Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Cldn16Q925N4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn16Q925N4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn16Q925N4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn16Q925N4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn16Q925N4 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn16Q925N4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn16Q925N4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn16Q925N4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
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Cldn16Q925N4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn16Q925N4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn16Q925N4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn16Q925N4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn16Q925N4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
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Cldn16Q925N4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cldn16Q925N4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn16Q925N4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn16Q925N4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn16Q925N4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn16Q925N4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn16Q925N4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn16Q925N4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn16Q925N4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn16Q925N4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn16Q925N4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Cldn16Q925N4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn16Q925N4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn16Q925N4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn16Q925N4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn16Q925N4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn16Q925N4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn16Q925N4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn16Q925N4 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Cldn16Q925N4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn16Q925N4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn16Q925N4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn16Q925N4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn16Q925N4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn16Q925N4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn16Q925N4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn16Q925N4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn16Q925N4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Cldn16Q925N4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn16Q925N4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Cldn16Q925N4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Cldn16Q925N4 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn16Q925N4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Cldn16Q925N4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn16Q925N4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Cldn16Q925N4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn16Q925N4 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn16Q925N4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn16Q925N4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn16Q925N4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn16Q925N4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn16Q925N4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Cldn16Q925N4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn16Q925N4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn16Q925N4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn16Q925N4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn16Q925N4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn16Q925N4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn16Q925N4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn16Q925N4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn16Q925N4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn16Q925N4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn16Q925N4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn16Q925N4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn16Q925N4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn16Q925N4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn16Q925N4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn16Q925N4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn16Q925N4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn16Q925N4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn16Q925N4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn16Q925N4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn16Q925N4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn16Q925N4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn16Q925N4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms