Protein–RNA interactions for Protein: Q925E0

Sntg2, Gamma-2-syntrophin, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sntg2Q925E0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sntg2Q925E0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sntg2Q925E0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sntg2Q925E0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sntg2Q925E0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sntg2Q925E0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sntg2Q925E0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sntg2Q925E0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sntg2Q925E0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sntg2Q925E0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sntg2Q925E0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sntg2Q925E0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sntg2Q925E0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sntg2Q925E0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sntg2Q925E0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sntg2Q925E0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sntg2Q925E0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sntg2Q925E0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sntg2Q925E0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sntg2Q925E0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sntg2Q925E0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sntg2Q925E0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sntg2Q925E0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sntg2Q925E0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sntg2Q925E0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Sntg2Q925E0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sntg2Q925E0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sntg2Q925E0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sntg2Q925E0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sntg2Q925E0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sntg2Q925E0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sntg2Q925E0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sntg2Q925E0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sntg2Q925E0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sntg2Q925E0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sntg2Q925E0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sntg2Q925E0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sntg2Q925E0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sntg2Q925E0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sntg2Q925E0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sntg2Q925E0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sntg2Q925E0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sntg2Q925E0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sntg2Q925E0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sntg2Q925E0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sntg2Q925E0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sntg2Q925E0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sntg2Q925E0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sntg2Q925E0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sntg2Q925E0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sntg2Q925E0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sntg2Q925E0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sntg2Q925E0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sntg2Q925E0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sntg2Q925E0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sntg2Q925E0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sntg2Q925E0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sntg2Q925E0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sntg2Q925E0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sntg2Q925E0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sntg2Q925E0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sntg2Q925E0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sntg2Q925E0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sntg2Q925E0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sntg2Q925E0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sntg2Q925E0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Sntg2Q925E0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sntg2Q925E0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sntg2Q925E0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sntg2Q925E0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sntg2Q925E0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sntg2Q925E0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sntg2Q925E0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sntg2Q925E0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sntg2Q925E0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sntg2Q925E0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sntg2Q925E0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sntg2Q925E0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sntg2Q925E0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sntg2Q925E0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sntg2Q925E0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sntg2Q925E0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sntg2Q925E0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sntg2Q925E0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sntg2Q925E0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sntg2Q925E0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sntg2Q925E0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Sntg2Q925E0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sntg2Q925E0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sntg2Q925E0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sntg2Q925E0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sntg2Q925E0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sntg2Q925E0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sntg2Q925E0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sntg2Q925E0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Sntg2Q925E0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sntg2Q925E0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sntg2Q925E0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sntg2Q925E0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sntg2Q925E0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms