Protein–RNA interactions for Protein: Q924S9

Ripply3, Protein ripply3, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripply3Q924S9 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ripply3Q924S9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ripply3Q924S9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ripply3Q924S9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ripply3Q924S9 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ripply3Q924S9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ripply3Q924S9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ripply3Q924S9 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ripply3Q924S9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ripply3Q924S9 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ripply3Q924S9 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ripply3Q924S9 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Ripply3Q924S9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ripply3Q924S9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ripply3Q924S9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ripply3Q924S9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ripply3Q924S9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ripply3Q924S9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ripply3Q924S9 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ripply3Q924S9 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ripply3Q924S9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ripply3Q924S9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ripply3Q924S9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ripply3Q924S9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ripply3Q924S9 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ripply3Q924S9 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ripply3Q924S9 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ripply3Q924S9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ripply3Q924S9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ripply3Q924S9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ripply3Q924S9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ripply3Q924S9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ripply3Q924S9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ripply3Q924S9 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ripply3Q924S9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ripply3Q924S9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ripply3Q924S9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ripply3Q924S9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ripply3Q924S9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ripply3Q924S9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ripply3Q924S9 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ripply3Q924S9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ripply3Q924S9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ripply3Q924S9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ripply3Q924S9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ripply3Q924S9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ripply3Q924S9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ripply3Q924S9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ripply3Q924S9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ripply3Q924S9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ripply3Q924S9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ripply3Q924S9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ripply3Q924S9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ripply3Q924S9 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ripply3Q924S9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ripply3Q924S9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ripply3Q924S9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ripply3Q924S9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ripply3Q924S9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ripply3Q924S9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ripply3Q924S9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ripply3Q924S9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ripply3Q924S9 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ripply3Q924S9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ripply3Q924S9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ripply3Q924S9 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ripply3Q924S9 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ripply3Q924S9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ripply3Q924S9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ripply3Q924S9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ripply3Q924S9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ripply3Q924S9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ripply3Q924S9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ripply3Q924S9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ripply3Q924S9 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ripply3Q924S9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ripply3Q924S9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ripply3Q924S9 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ripply3Q924S9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ripply3Q924S9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ripply3Q924S9 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ripply3Q924S9 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ripply3Q924S9 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ripply3Q924S9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ripply3Q924S9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ripply3Q924S9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ripply3Q924S9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ripply3Q924S9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ripply3Q924S9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ripply3Q924S9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ripply3Q924S9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ripply3Q924S9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ripply3Q924S9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ripply3Q924S9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ripply3Q924S9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ripply3Q924S9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ripply3Q924S9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Ripply3Q924S9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ripply3Q924S9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ripply3Q924S9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms