Protein–RNA interactions for Protein: Q921I6

Sh3bp4, SH3 domain-binding protein 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp4Q921I6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sh3bp4Q921I6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sh3bp4Q921I6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sh3bp4Q921I6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sh3bp4Q921I6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sh3bp4Q921I6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sh3bp4Q921I6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sh3bp4Q921I6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sh3bp4Q921I6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sh3bp4Q921I6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sh3bp4Q921I6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sh3bp4Q921I6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sh3bp4Q921I6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Sh3bp4Q921I6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sh3bp4Q921I6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sh3bp4Q921I6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sh3bp4Q921I6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sh3bp4Q921I6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sh3bp4Q921I6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sh3bp4Q921I6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sh3bp4Q921I6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sh3bp4Q921I6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Sh3bp4Q921I6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sh3bp4Q921I6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sh3bp4Q921I6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sh3bp4Q921I6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sh3bp4Q921I6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sh3bp4Q921I6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sh3bp4Q921I6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sh3bp4Q921I6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sh3bp4Q921I6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sh3bp4Q921I6 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sh3bp4Q921I6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sh3bp4Q921I6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sh3bp4Q921I6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sh3bp4Q921I6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Sh3bp4Q921I6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sh3bp4Q921I6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sh3bp4Q921I6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Sh3bp4Q921I6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sh3bp4Q921I6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sh3bp4Q921I6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Sh3bp4Q921I6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sh3bp4Q921I6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sh3bp4Q921I6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sh3bp4Q921I6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sh3bp4Q921I6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sh3bp4Q921I6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sh3bp4Q921I6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sh3bp4Q921I6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sh3bp4Q921I6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sh3bp4Q921I6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Sh3bp4Q921I6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sh3bp4Q921I6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sh3bp4Q921I6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sh3bp4Q921I6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sh3bp4Q921I6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sh3bp4Q921I6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sh3bp4Q921I6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sh3bp4Q921I6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sh3bp4Q921I6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sh3bp4Q921I6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sh3bp4Q921I6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sh3bp4Q921I6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sh3bp4Q921I6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sh3bp4Q921I6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sh3bp4Q921I6 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sh3bp4Q921I6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sh3bp4Q921I6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sh3bp4Q921I6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sh3bp4Q921I6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sh3bp4Q921I6 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sh3bp4Q921I6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sh3bp4Q921I6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sh3bp4Q921I6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sh3bp4Q921I6 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sh3bp4Q921I6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sh3bp4Q921I6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sh3bp4Q921I6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sh3bp4Q921I6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sh3bp4Q921I6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sh3bp4Q921I6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sh3bp4Q921I6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sh3bp4Q921I6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sh3bp4Q921I6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sh3bp4Q921I6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sh3bp4Q921I6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sh3bp4Q921I6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sh3bp4Q921I6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sh3bp4Q921I6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sh3bp4Q921I6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sh3bp4Q921I6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sh3bp4Q921I6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sh3bp4Q921I6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sh3bp4Q921I6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sh3bp4Q921I6 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sh3bp4Q921I6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sh3bp4Q921I6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sh3bp4Q921I6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Sh3bp4Q921I6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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