Protein–RNA interactions for Protein: Q921E6

Eed, Polycomb protein EED, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EedQ921E6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EedQ921E6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EedQ921E6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EedQ921E6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EedQ921E6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EedQ921E6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EedQ921E6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EedQ921E6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EedQ921E6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EedQ921E6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EedQ921E6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
EedQ921E6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
EedQ921E6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
EedQ921E6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
EedQ921E6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
EedQ921E6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EedQ921E6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EedQ921E6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EedQ921E6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EedQ921E6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EedQ921E6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EedQ921E6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EedQ921E6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EedQ921E6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EedQ921E6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EedQ921E6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EedQ921E6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EedQ921E6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EedQ921E6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EedQ921E6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EedQ921E6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EedQ921E6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EedQ921E6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
EedQ921E6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EedQ921E6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EedQ921E6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EedQ921E6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EedQ921E6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EedQ921E6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EedQ921E6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
EedQ921E6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
EedQ921E6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EedQ921E6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
EedQ921E6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EedQ921E6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EedQ921E6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EedQ921E6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EedQ921E6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EedQ921E6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EedQ921E6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
EedQ921E6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EedQ921E6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EedQ921E6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EedQ921E6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EedQ921E6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EedQ921E6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EedQ921E6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EedQ921E6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EedQ921E6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EedQ921E6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EedQ921E6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EedQ921E6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EedQ921E6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EedQ921E6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EedQ921E6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EedQ921E6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EedQ921E6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EedQ921E6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EedQ921E6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EedQ921E6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EedQ921E6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EedQ921E6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EedQ921E6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EedQ921E6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
EedQ921E6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EedQ921E6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EedQ921E6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EedQ921E6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EedQ921E6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EedQ921E6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EedQ921E6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EedQ921E6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
EedQ921E6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EedQ921E6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EedQ921E6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EedQ921E6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EedQ921E6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EedQ921E6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EedQ921E6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EedQ921E6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EedQ921E6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EedQ921E6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EedQ921E6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EedQ921E6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EedQ921E6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EedQ921E6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
EedQ921E6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EedQ921E6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EedQ921E6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EedQ921E6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms