Protein–RNA interactions for Protein: Q920N2

Hlcs, Biotin--protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HlcsQ920N2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HlcsQ920N2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HlcsQ920N2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HlcsQ920N2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HlcsQ920N2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HlcsQ920N2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HlcsQ920N2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HlcsQ920N2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HlcsQ920N2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HlcsQ920N2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HlcsQ920N2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HlcsQ920N2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HlcsQ920N2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HlcsQ920N2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HlcsQ920N2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HlcsQ920N2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HlcsQ920N2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HlcsQ920N2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HlcsQ920N2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HlcsQ920N2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HlcsQ920N2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HlcsQ920N2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HlcsQ920N2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HlcsQ920N2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HlcsQ920N2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HlcsQ920N2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HlcsQ920N2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HlcsQ920N2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HlcsQ920N2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HlcsQ920N2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HlcsQ920N2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HlcsQ920N2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HlcsQ920N2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HlcsQ920N2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HlcsQ920N2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HlcsQ920N2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HlcsQ920N2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HlcsQ920N2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HlcsQ920N2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HlcsQ920N2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HlcsQ920N2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HlcsQ920N2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HlcsQ920N2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HlcsQ920N2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HlcsQ920N2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HlcsQ920N2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HlcsQ920N2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HlcsQ920N2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HlcsQ920N2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HlcsQ920N2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HlcsQ920N2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HlcsQ920N2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HlcsQ920N2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HlcsQ920N2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HlcsQ920N2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HlcsQ920N2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HlcsQ920N2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HlcsQ920N2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HlcsQ920N2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HlcsQ920N2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HlcsQ920N2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HlcsQ920N2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HlcsQ920N2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HlcsQ920N2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HlcsQ920N2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HlcsQ920N2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HlcsQ920N2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HlcsQ920N2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HlcsQ920N2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HlcsQ920N2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HlcsQ920N2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HlcsQ920N2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HlcsQ920N2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HlcsQ920N2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HlcsQ920N2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HlcsQ920N2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HlcsQ920N2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HlcsQ920N2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HlcsQ920N2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HlcsQ920N2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HlcsQ920N2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HlcsQ920N2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HlcsQ920N2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HlcsQ920N2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HlcsQ920N2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HlcsQ920N2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HlcsQ920N2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HlcsQ920N2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HlcsQ920N2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HlcsQ920N2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HlcsQ920N2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HlcsQ920N2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HlcsQ920N2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HlcsQ920N2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HlcsQ920N2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HlcsQ920N2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HlcsQ920N2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HlcsQ920N2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HlcsQ920N2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HlcsQ920N2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms