Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Odf3Q920N1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Odf3Q920N1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Odf3Q920N1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Odf3Q920N1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Odf3Q920N1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Odf3Q920N1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Odf3Q920N1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Odf3Q920N1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Odf3Q920N1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Odf3Q920N1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Odf3Q920N1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Odf3Q920N1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Odf3Q920N1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Odf3Q920N1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Odf3Q920N1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Odf3Q920N1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Odf3Q920N1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Odf3Q920N1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Odf3Q920N1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Odf3Q920N1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Odf3Q920N1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Odf3Q920N1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Odf3Q920N1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Odf3Q920N1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Odf3Q920N1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Odf3Q920N1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Odf3Q920N1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Odf3Q920N1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Odf3Q920N1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Odf3Q920N1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Odf3Q920N1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Odf3Q920N1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Odf3Q920N1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Odf3Q920N1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Odf3Q920N1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Odf3Q920N1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Odf3Q920N1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Odf3Q920N1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Odf3Q920N1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Odf3Q920N1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Odf3Q920N1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Odf3Q920N1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Odf3Q920N1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Odf3Q920N1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Odf3Q920N1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Odf3Q920N1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Odf3Q920N1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Odf3Q920N1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Odf3Q920N1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Odf3Q920N1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Odf3Q920N1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Odf3Q920N1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Odf3Q920N1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Odf3Q920N1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Odf3Q920N1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Odf3Q920N1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Odf3Q920N1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Odf3Q920N1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Odf3Q920N1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Odf3Q920N1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Odf3Q920N1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Odf3Q920N1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Odf3Q920N1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Odf3Q920N1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Odf3Q920N1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Odf3Q920N1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Odf3Q920N1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Odf3Q920N1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Odf3Q920N1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Odf3Q920N1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Odf3Q920N1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Odf3Q920N1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Odf3Q920N1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Odf3Q920N1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Odf3Q920N1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Odf3Q920N1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Odf3Q920N1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Odf3Q920N1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Odf3Q920N1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Odf3Q920N1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Odf3Q920N1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Odf3Q920N1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Odf3Q920N1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Odf3Q920N1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Odf3Q920N1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Odf3Q920N1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Odf3Q920N1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Odf3Q920N1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Odf3Q920N1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Odf3Q920N1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Odf3Q920N1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Odf3Q920N1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Odf3Q920N1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Odf3Q920N1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Odf3Q920N1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Odf3Q920N1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Odf3Q920N1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Odf3Q920N1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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