Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smarca5Q91ZW3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Smarca5Q91ZW3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smarca5Q91ZW3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smarca5Q91ZW3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smarca5Q91ZW3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smarca5Q91ZW3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Smarca5Q91ZW3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smarca5Q91ZW3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smarca5Q91ZW3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smarca5Q91ZW3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smarca5Q91ZW3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smarca5Q91ZW3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smarca5Q91ZW3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Smarca5Q91ZW3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smarca5Q91ZW3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smarca5Q91ZW3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smarca5Q91ZW3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Smarca5Q91ZW3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smarca5Q91ZW3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smarca5Q91ZW3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smarca5Q91ZW3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smarca5Q91ZW3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smarca5Q91ZW3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smarca5Q91ZW3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smarca5Q91ZW3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smarca5Q91ZW3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smarca5Q91ZW3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smarca5Q91ZW3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smarca5Q91ZW3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smarca5Q91ZW3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smarca5Q91ZW3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smarca5Q91ZW3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smarca5Q91ZW3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Smarca5Q91ZW3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smarca5Q91ZW3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smarca5Q91ZW3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smarca5Q91ZW3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smarca5Q91ZW3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smarca5Q91ZW3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smarca5Q91ZW3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smarca5Q91ZW3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Smarca5Q91ZW3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smarca5Q91ZW3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smarca5Q91ZW3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smarca5Q91ZW3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smarca5Q91ZW3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smarca5Q91ZW3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smarca5Q91ZW3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smarca5Q91ZW3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smarca5Q91ZW3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smarca5Q91ZW3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smarca5Q91ZW3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smarca5Q91ZW3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smarca5Q91ZW3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smarca5Q91ZW3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smarca5Q91ZW3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smarca5Q91ZW3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smarca5Q91ZW3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smarca5Q91ZW3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smarca5Q91ZW3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smarca5Q91ZW3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smarca5Q91ZW3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smarca5Q91ZW3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smarca5Q91ZW3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smarca5Q91ZW3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Smarca5Q91ZW3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smarca5Q91ZW3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smarca5Q91ZW3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smarca5Q91ZW3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smarca5Q91ZW3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smarca5Q91ZW3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smarca5Q91ZW3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smarca5Q91ZW3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smarca5Q91ZW3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smarca5Q91ZW3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smarca5Q91ZW3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Smarca5Q91ZW3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smarca5Q91ZW3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smarca5Q91ZW3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smarca5Q91ZW3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smarca5Q91ZW3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smarca5Q91ZW3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smarca5Q91ZW3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smarca5Q91ZW3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smarca5Q91ZW3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smarca5Q91ZW3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smarca5Q91ZW3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smarca5Q91ZW3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smarca5Q91ZW3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smarca5Q91ZW3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smarca5Q91ZW3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Smarca5Q91ZW3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smarca5Q91ZW3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smarca5Q91ZW3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smarca5Q91ZW3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smarca5Q91ZW3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smarca5Q91ZW3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smarca5Q91ZW3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Smarca5Q91ZW3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.5 ms