Protein–RNA interactions for Protein: Q91YY4

Atpaf2, ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atpaf2Q91YY4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atpaf2Q91YY4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atpaf2Q91YY4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atpaf2Q91YY4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atpaf2Q91YY4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atpaf2Q91YY4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atpaf2Q91YY4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atpaf2Q91YY4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atpaf2Q91YY4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atpaf2Q91YY4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atpaf2Q91YY4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atpaf2Q91YY4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atpaf2Q91YY4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atpaf2Q91YY4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Atpaf2Q91YY4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atpaf2Q91YY4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atpaf2Q91YY4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atpaf2Q91YY4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atpaf2Q91YY4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atpaf2Q91YY4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atpaf2Q91YY4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atpaf2Q91YY4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atpaf2Q91YY4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atpaf2Q91YY4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atpaf2Q91YY4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atpaf2Q91YY4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atpaf2Q91YY4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atpaf2Q91YY4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Atpaf2Q91YY4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atpaf2Q91YY4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atpaf2Q91YY4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atpaf2Q91YY4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Atpaf2Q91YY4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Atpaf2Q91YY4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Atpaf2Q91YY4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atpaf2Q91YY4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atpaf2Q91YY4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atpaf2Q91YY4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atpaf2Q91YY4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atpaf2Q91YY4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atpaf2Q91YY4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atpaf2Q91YY4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atpaf2Q91YY4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atpaf2Q91YY4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atpaf2Q91YY4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Atpaf2Q91YY4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Atpaf2Q91YY4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atpaf2Q91YY4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atpaf2Q91YY4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atpaf2Q91YY4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atpaf2Q91YY4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atpaf2Q91YY4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atpaf2Q91YY4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atpaf2Q91YY4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Atpaf2Q91YY4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atpaf2Q91YY4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atpaf2Q91YY4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atpaf2Q91YY4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atpaf2Q91YY4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atpaf2Q91YY4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atpaf2Q91YY4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atpaf2Q91YY4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atpaf2Q91YY4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atpaf2Q91YY4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atpaf2Q91YY4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atpaf2Q91YY4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atpaf2Q91YY4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atpaf2Q91YY4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atpaf2Q91YY4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atpaf2Q91YY4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atpaf2Q91YY4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atpaf2Q91YY4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Atpaf2Q91YY4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atpaf2Q91YY4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atpaf2Q91YY4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atpaf2Q91YY4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atpaf2Q91YY4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atpaf2Q91YY4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atpaf2Q91YY4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atpaf2Q91YY4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atpaf2Q91YY4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atpaf2Q91YY4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atpaf2Q91YY4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atpaf2Q91YY4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atpaf2Q91YY4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atpaf2Q91YY4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atpaf2Q91YY4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atpaf2Q91YY4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atpaf2Q91YY4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atpaf2Q91YY4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atpaf2Q91YY4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atpaf2Q91YY4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atpaf2Q91YY4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atpaf2Q91YY4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atpaf2Q91YY4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atpaf2Q91YY4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atpaf2Q91YY4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Atpaf2Q91YY4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atpaf2Q91YY4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atpaf2Q91YY4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms