Protein–RNA interactions for Protein: Q91XE9

Creb3l3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3l3Q91XE9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Creb3l3Q91XE9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Creb3l3Q91XE9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Creb3l3Q91XE9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Creb3l3Q91XE9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Creb3l3Q91XE9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Creb3l3Q91XE9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Creb3l3Q91XE9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Creb3l3Q91XE9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Creb3l3Q91XE9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Creb3l3Q91XE9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Creb3l3Q91XE9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Creb3l3Q91XE9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Creb3l3Q91XE9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Creb3l3Q91XE9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Creb3l3Q91XE9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Creb3l3Q91XE9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Creb3l3Q91XE9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Creb3l3Q91XE9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Creb3l3Q91XE9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Creb3l3Q91XE9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Creb3l3Q91XE9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Creb3l3Q91XE9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Creb3l3Q91XE9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Creb3l3Q91XE9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Creb3l3Q91XE9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Creb3l3Q91XE9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Creb3l3Q91XE9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Creb3l3Q91XE9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Creb3l3Q91XE9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Creb3l3Q91XE9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Creb3l3Q91XE9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Creb3l3Q91XE9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Creb3l3Q91XE9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Creb3l3Q91XE9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Creb3l3Q91XE9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Creb3l3Q91XE9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Creb3l3Q91XE9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Creb3l3Q91XE9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Creb3l3Q91XE9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Creb3l3Q91XE9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Creb3l3Q91XE9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Creb3l3Q91XE9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Creb3l3Q91XE9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Creb3l3Q91XE9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Creb3l3Q91XE9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Creb3l3Q91XE9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Creb3l3Q91XE9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Creb3l3Q91XE9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Creb3l3Q91XE9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Creb3l3Q91XE9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Creb3l3Q91XE9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Creb3l3Q91XE9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Creb3l3Q91XE9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Creb3l3Q91XE9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Creb3l3Q91XE9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Creb3l3Q91XE9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Creb3l3Q91XE9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Creb3l3Q91XE9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Creb3l3Q91XE9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Creb3l3Q91XE9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Creb3l3Q91XE9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Creb3l3Q91XE9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Creb3l3Q91XE9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Creb3l3Q91XE9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Creb3l3Q91XE9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Creb3l3Q91XE9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Creb3l3Q91XE9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Creb3l3Q91XE9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Creb3l3Q91XE9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Creb3l3Q91XE9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Creb3l3Q91XE9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Creb3l3Q91XE9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Creb3l3Q91XE9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Creb3l3Q91XE9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Creb3l3Q91XE9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Creb3l3Q91XE9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Creb3l3Q91XE9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Creb3l3Q91XE9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Creb3l3Q91XE9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Creb3l3Q91XE9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Creb3l3Q91XE9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Creb3l3Q91XE9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Creb3l3Q91XE9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Creb3l3Q91XE9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Creb3l3Q91XE9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Creb3l3Q91XE9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Creb3l3Q91XE9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Creb3l3Q91XE9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Creb3l3Q91XE9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Creb3l3Q91XE9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Creb3l3Q91XE9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Creb3l3Q91XE9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Creb3l3Q91XE9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Creb3l3Q91XE9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Creb3l3Q91XE9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Creb3l3Q91XE9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Creb3l3Q91XE9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Creb3l3Q91XE9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Creb3l3Q91XE9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms