Protein–RNA interactions for Protein: Q91XB0

Trex1, Three-prime repair exonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trex1Q91XB0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trex1Q91XB0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trex1Q91XB0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trex1Q91XB0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trex1Q91XB0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Trex1Q91XB0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trex1Q91XB0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trex1Q91XB0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trex1Q91XB0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trex1Q91XB0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trex1Q91XB0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trex1Q91XB0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trex1Q91XB0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trex1Q91XB0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trex1Q91XB0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trex1Q91XB0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trex1Q91XB0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trex1Q91XB0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trex1Q91XB0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trex1Q91XB0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trex1Q91XB0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trex1Q91XB0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trex1Q91XB0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trex1Q91XB0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trex1Q91XB0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trex1Q91XB0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trex1Q91XB0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trex1Q91XB0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trex1Q91XB0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trex1Q91XB0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Trex1Q91XB0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trex1Q91XB0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trex1Q91XB0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trex1Q91XB0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trex1Q91XB0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trex1Q91XB0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trex1Q91XB0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trex1Q91XB0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trex1Q91XB0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trex1Q91XB0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trex1Q91XB0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trex1Q91XB0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trex1Q91XB0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trex1Q91XB0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trex1Q91XB0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trex1Q91XB0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trex1Q91XB0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trex1Q91XB0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trex1Q91XB0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trex1Q91XB0 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trex1Q91XB0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trex1Q91XB0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trex1Q91XB0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trex1Q91XB0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Trex1Q91XB0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trex1Q91XB0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trex1Q91XB0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Trex1Q91XB0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trex1Q91XB0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trex1Q91XB0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trex1Q91XB0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trex1Q91XB0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trex1Q91XB0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trex1Q91XB0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trex1Q91XB0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trex1Q91XB0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trex1Q91XB0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trex1Q91XB0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trex1Q91XB0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trex1Q91XB0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trex1Q91XB0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trex1Q91XB0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trex1Q91XB0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trex1Q91XB0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trex1Q91XB0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trex1Q91XB0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trex1Q91XB0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trex1Q91XB0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trex1Q91XB0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trex1Q91XB0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trex1Q91XB0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trex1Q91XB0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trex1Q91XB0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trex1Q91XB0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trex1Q91XB0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trex1Q91XB0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trex1Q91XB0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trex1Q91XB0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trex1Q91XB0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trex1Q91XB0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trex1Q91XB0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trex1Q91XB0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trex1Q91XB0 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Trex1Q91XB0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trex1Q91XB0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trex1Q91XB0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Trex1Q91XB0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Trex1Q91XB0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trex1Q91XB0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trex1Q91XB0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms