Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC0

Setd3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd3Q91WC0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Setd3Q91WC0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Setd3Q91WC0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Setd3Q91WC0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Setd3Q91WC0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Setd3Q91WC0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Setd3Q91WC0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Setd3Q91WC0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Setd3Q91WC0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Setd3Q91WC0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Setd3Q91WC0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Setd3Q91WC0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Setd3Q91WC0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Setd3Q91WC0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Setd3Q91WC0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Setd3Q91WC0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Setd3Q91WC0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Setd3Q91WC0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Setd3Q91WC0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Setd3Q91WC0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Setd3Q91WC0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Setd3Q91WC0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Setd3Q91WC0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Setd3Q91WC0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Setd3Q91WC0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Setd3Q91WC0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Setd3Q91WC0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Setd3Q91WC0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Setd3Q91WC0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Setd3Q91WC0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Setd3Q91WC0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Setd3Q91WC0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Setd3Q91WC0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Setd3Q91WC0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Setd3Q91WC0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Setd3Q91WC0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Setd3Q91WC0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Setd3Q91WC0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Setd3Q91WC0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Setd3Q91WC0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Setd3Q91WC0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Setd3Q91WC0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Setd3Q91WC0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Setd3Q91WC0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Setd3Q91WC0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Setd3Q91WC0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Setd3Q91WC0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Setd3Q91WC0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Setd3Q91WC0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Setd3Q91WC0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Setd3Q91WC0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Setd3Q91WC0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Setd3Q91WC0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Setd3Q91WC0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Setd3Q91WC0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Setd3Q91WC0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Setd3Q91WC0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Setd3Q91WC0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Setd3Q91WC0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Setd3Q91WC0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Setd3Q91WC0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Setd3Q91WC0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Setd3Q91WC0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Setd3Q91WC0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Setd3Q91WC0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Setd3Q91WC0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Setd3Q91WC0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Setd3Q91WC0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Setd3Q91WC0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Setd3Q91WC0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Setd3Q91WC0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Setd3Q91WC0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Setd3Q91WC0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Setd3Q91WC0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Setd3Q91WC0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Setd3Q91WC0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Setd3Q91WC0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Setd3Q91WC0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Setd3Q91WC0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Setd3Q91WC0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Setd3Q91WC0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Setd3Q91WC0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Setd3Q91WC0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Setd3Q91WC0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Setd3Q91WC0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Setd3Q91WC0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Setd3Q91WC0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Setd3Q91WC0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Setd3Q91WC0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Setd3Q91WC0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Setd3Q91WC0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Setd3Q91WC0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Setd3Q91WC0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Setd3Q91WC0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Setd3Q91WC0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Setd3Q91WC0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Setd3Q91WC0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Setd3Q91WC0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Setd3Q91WC0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Setd3Q91WC0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms