Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp3Q91W36 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp3Q91W36 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp3Q91W36 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp3Q91W36 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp3Q91W36 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp3Q91W36 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp3Q91W36 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp3Q91W36 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp3Q91W36 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp3Q91W36 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp3Q91W36 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp3Q91W36 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp3Q91W36 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp3Q91W36 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Usp3Q91W36 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Usp3Q91W36 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp3Q91W36 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp3Q91W36 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp3Q91W36 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp3Q91W36 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp3Q91W36 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp3Q91W36 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp3Q91W36 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp3Q91W36 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp3Q91W36 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp3Q91W36 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp3Q91W36 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp3Q91W36 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp3Q91W36 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp3Q91W36 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp3Q91W36 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp3Q91W36 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp3Q91W36 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp3Q91W36 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp3Q91W36 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp3Q91W36 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp3Q91W36 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp3Q91W36 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp3Q91W36 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp3Q91W36 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp3Q91W36 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp3Q91W36 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp3Q91W36 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp3Q91W36 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp3Q91W36 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp3Q91W36 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp3Q91W36 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp3Q91W36 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp3Q91W36 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp3Q91W36 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp3Q91W36 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp3Q91W36 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp3Q91W36 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp3Q91W36 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp3Q91W36 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp3Q91W36 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp3Q91W36 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp3Q91W36 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp3Q91W36 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp3Q91W36 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp3Q91W36 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp3Q91W36 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp3Q91W36 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp3Q91W36 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp3Q91W36 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp3Q91W36 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp3Q91W36 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp3Q91W36 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp3Q91W36 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp3Q91W36 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp3Q91W36 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp3Q91W36 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp3Q91W36 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp3Q91W36 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp3Q91W36 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp3Q91W36 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp3Q91W36 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp3Q91W36 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp3Q91W36 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp3Q91W36 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp3Q91W36 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp3Q91W36 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp3Q91W36 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp3Q91W36 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp3Q91W36 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp3Q91W36 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp3Q91W36 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp3Q91W36 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp3Q91W36 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp3Q91W36 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp3Q91W36 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp3Q91W36 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp3Q91W36 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp3Q91W36 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp3Q91W36 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp3Q91W36 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp3Q91W36 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp3Q91W36 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp3Q91W36 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms