Protein–RNA interactions for Protein: Q91W18

Tdrd3, Tudor domain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd3Q91W18 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tdrd3Q91W18 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tdrd3Q91W18 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tdrd3Q91W18 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tdrd3Q91W18 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tdrd3Q91W18 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tdrd3Q91W18 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tdrd3Q91W18 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tdrd3Q91W18 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tdrd3Q91W18 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tdrd3Q91W18 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tdrd3Q91W18 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tdrd3Q91W18 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tdrd3Q91W18 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Tdrd3Q91W18 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tdrd3Q91W18 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tdrd3Q91W18 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tdrd3Q91W18 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tdrd3Q91W18 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Tdrd3Q91W18 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tdrd3Q91W18 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Tdrd3Q91W18 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tdrd3Q91W18 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tdrd3Q91W18 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tdrd3Q91W18 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tdrd3Q91W18 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tdrd3Q91W18 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tdrd3Q91W18 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tdrd3Q91W18 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tdrd3Q91W18 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tdrd3Q91W18 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tdrd3Q91W18 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tdrd3Q91W18 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tdrd3Q91W18 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tdrd3Q91W18 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tdrd3Q91W18 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tdrd3Q91W18 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tdrd3Q91W18 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tdrd3Q91W18 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tdrd3Q91W18 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tdrd3Q91W18 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tdrd3Q91W18 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tdrd3Q91W18 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tdrd3Q91W18 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tdrd3Q91W18 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tdrd3Q91W18 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tdrd3Q91W18 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tdrd3Q91W18 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tdrd3Q91W18 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tdrd3Q91W18 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Tdrd3Q91W18 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tdrd3Q91W18 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Tdrd3Q91W18 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tdrd3Q91W18 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tdrd3Q91W18 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tdrd3Q91W18 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tdrd3Q91W18 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tdrd3Q91W18 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tdrd3Q91W18 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tdrd3Q91W18 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tdrd3Q91W18 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tdrd3Q91W18 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tdrd3Q91W18 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tdrd3Q91W18 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tdrd3Q91W18 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tdrd3Q91W18 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tdrd3Q91W18 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tdrd3Q91W18 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tdrd3Q91W18 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tdrd3Q91W18 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tdrd3Q91W18 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tdrd3Q91W18 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tdrd3Q91W18 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tdrd3Q91W18 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tdrd3Q91W18 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tdrd3Q91W18 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tdrd3Q91W18 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tdrd3Q91W18 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tdrd3Q91W18 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tdrd3Q91W18 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Tdrd3Q91W18 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tdrd3Q91W18 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tdrd3Q91W18 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tdrd3Q91W18 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tdrd3Q91W18 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tdrd3Q91W18 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tdrd3Q91W18 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tdrd3Q91W18 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tdrd3Q91W18 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tdrd3Q91W18 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tdrd3Q91W18 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tdrd3Q91W18 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tdrd3Q91W18 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tdrd3Q91W18 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tdrd3Q91W18 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tdrd3Q91W18 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tdrd3Q91W18 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tdrd3Q91W18 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tdrd3Q91W18 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tdrd3Q91W18 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms