Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHW2

Cacng8, Voltage-dependent calcium channel gamma-8 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng8Q8VHW2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacng8Q8VHW2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacng8Q8VHW2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacng8Q8VHW2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacng8Q8VHW2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacng8Q8VHW2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacng8Q8VHW2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacng8Q8VHW2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacng8Q8VHW2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacng8Q8VHW2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacng8Q8VHW2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacng8Q8VHW2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacng8Q8VHW2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacng8Q8VHW2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacng8Q8VHW2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacng8Q8VHW2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacng8Q8VHW2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacng8Q8VHW2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacng8Q8VHW2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacng8Q8VHW2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cacng8Q8VHW2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cacng8Q8VHW2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cacng8Q8VHW2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cacng8Q8VHW2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cacng8Q8VHW2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacng8Q8VHW2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacng8Q8VHW2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacng8Q8VHW2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacng8Q8VHW2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacng8Q8VHW2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacng8Q8VHW2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacng8Q8VHW2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacng8Q8VHW2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacng8Q8VHW2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacng8Q8VHW2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacng8Q8VHW2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacng8Q8VHW2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacng8Q8VHW2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacng8Q8VHW2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacng8Q8VHW2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacng8Q8VHW2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacng8Q8VHW2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacng8Q8VHW2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacng8Q8VHW2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacng8Q8VHW2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacng8Q8VHW2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacng8Q8VHW2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacng8Q8VHW2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacng8Q8VHW2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacng8Q8VHW2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacng8Q8VHW2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacng8Q8VHW2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacng8Q8VHW2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacng8Q8VHW2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacng8Q8VHW2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacng8Q8VHW2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacng8Q8VHW2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacng8Q8VHW2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacng8Q8VHW2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacng8Q8VHW2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacng8Q8VHW2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacng8Q8VHW2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacng8Q8VHW2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacng8Q8VHW2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacng8Q8VHW2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacng8Q8VHW2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacng8Q8VHW2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacng8Q8VHW2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacng8Q8VHW2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacng8Q8VHW2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacng8Q8VHW2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacng8Q8VHW2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacng8Q8VHW2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacng8Q8VHW2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacng8Q8VHW2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacng8Q8VHW2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacng8Q8VHW2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacng8Q8VHW2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacng8Q8VHW2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacng8Q8VHW2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacng8Q8VHW2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacng8Q8VHW2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacng8Q8VHW2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacng8Q8VHW2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacng8Q8VHW2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacng8Q8VHW2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacng8Q8VHW2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacng8Q8VHW2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacng8Q8VHW2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacng8Q8VHW2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacng8Q8VHW2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacng8Q8VHW2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacng8Q8VHW2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacng8Q8VHW2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacng8Q8VHW2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacng8Q8VHW2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacng8Q8VHW2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacng8Q8VHW2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacng8Q8VHW2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacng8Q8VHW2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms