Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC3

Selenom, Selenoprotein M, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenomQ8VHC3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SelenomQ8VHC3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SelenomQ8VHC3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SelenomQ8VHC3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SelenomQ8VHC3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SelenomQ8VHC3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SelenomQ8VHC3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SelenomQ8VHC3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SelenomQ8VHC3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SelenomQ8VHC3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SelenomQ8VHC3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SelenomQ8VHC3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SelenomQ8VHC3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SelenomQ8VHC3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SelenomQ8VHC3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SelenomQ8VHC3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SelenomQ8VHC3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SelenomQ8VHC3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SelenomQ8VHC3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SelenomQ8VHC3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SelenomQ8VHC3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SelenomQ8VHC3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SelenomQ8VHC3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SelenomQ8VHC3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SelenomQ8VHC3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SelenomQ8VHC3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SelenomQ8VHC3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SelenomQ8VHC3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SelenomQ8VHC3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SelenomQ8VHC3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SelenomQ8VHC3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SelenomQ8VHC3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SelenomQ8VHC3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SelenomQ8VHC3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SelenomQ8VHC3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SelenomQ8VHC3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SelenomQ8VHC3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SelenomQ8VHC3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SelenomQ8VHC3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SelenomQ8VHC3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SelenomQ8VHC3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SelenomQ8VHC3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SelenomQ8VHC3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SelenomQ8VHC3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SelenomQ8VHC3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SelenomQ8VHC3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SelenomQ8VHC3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SelenomQ8VHC3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SelenomQ8VHC3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SelenomQ8VHC3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SelenomQ8VHC3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SelenomQ8VHC3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SelenomQ8VHC3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SelenomQ8VHC3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SelenomQ8VHC3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SelenomQ8VHC3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SelenomQ8VHC3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SelenomQ8VHC3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SelenomQ8VHC3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SelenomQ8VHC3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SelenomQ8VHC3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SelenomQ8VHC3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SelenomQ8VHC3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SelenomQ8VHC3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SelenomQ8VHC3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SelenomQ8VHC3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SelenomQ8VHC3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SelenomQ8VHC3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SelenomQ8VHC3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SelenomQ8VHC3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SelenomQ8VHC3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SelenomQ8VHC3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SelenomQ8VHC3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SelenomQ8VHC3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SelenomQ8VHC3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SelenomQ8VHC3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SelenomQ8VHC3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SelenomQ8VHC3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SelenomQ8VHC3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SelenomQ8VHC3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SelenomQ8VHC3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SelenomQ8VHC3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SelenomQ8VHC3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SelenomQ8VHC3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SelenomQ8VHC3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SelenomQ8VHC3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SelenomQ8VHC3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SelenomQ8VHC3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SelenomQ8VHC3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SelenomQ8VHC3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SelenomQ8VHC3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SelenomQ8VHC3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SelenomQ8VHC3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SelenomQ8VHC3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SelenomQ8VHC3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SelenomQ8VHC3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SelenomQ8VHC3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SelenomQ8VHC3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SelenomQ8VHC3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SelenomQ8VHC3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms