Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDU5

Snrk, SNF-related serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrkQ8VDU5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SnrkQ8VDU5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SnrkQ8VDU5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SnrkQ8VDU5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SnrkQ8VDU5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SnrkQ8VDU5 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SnrkQ8VDU5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SnrkQ8VDU5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SnrkQ8VDU5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SnrkQ8VDU5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SnrkQ8VDU5 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SnrkQ8VDU5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SnrkQ8VDU5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SnrkQ8VDU5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SnrkQ8VDU5 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SnrkQ8VDU5 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SnrkQ8VDU5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SnrkQ8VDU5 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SnrkQ8VDU5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SnrkQ8VDU5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SnrkQ8VDU5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SnrkQ8VDU5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SnrkQ8VDU5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SnrkQ8VDU5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SnrkQ8VDU5 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SnrkQ8VDU5 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SnrkQ8VDU5 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SnrkQ8VDU5 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SnrkQ8VDU5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SnrkQ8VDU5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SnrkQ8VDU5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SnrkQ8VDU5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SnrkQ8VDU5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SnrkQ8VDU5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SnrkQ8VDU5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SnrkQ8VDU5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SnrkQ8VDU5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SnrkQ8VDU5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SnrkQ8VDU5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SnrkQ8VDU5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SnrkQ8VDU5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SnrkQ8VDU5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SnrkQ8VDU5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SnrkQ8VDU5 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SnrkQ8VDU5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SnrkQ8VDU5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SnrkQ8VDU5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SnrkQ8VDU5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SnrkQ8VDU5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SnrkQ8VDU5 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SnrkQ8VDU5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SnrkQ8VDU5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SnrkQ8VDU5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SnrkQ8VDU5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SnrkQ8VDU5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SnrkQ8VDU5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SnrkQ8VDU5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SnrkQ8VDU5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SnrkQ8VDU5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SnrkQ8VDU5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SnrkQ8VDU5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SnrkQ8VDU5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SnrkQ8VDU5 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SnrkQ8VDU5 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SnrkQ8VDU5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SnrkQ8VDU5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SnrkQ8VDU5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SnrkQ8VDU5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SnrkQ8VDU5 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SnrkQ8VDU5 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SnrkQ8VDU5 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SnrkQ8VDU5 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SnrkQ8VDU5 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SnrkQ8VDU5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SnrkQ8VDU5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SnrkQ8VDU5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SnrkQ8VDU5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SnrkQ8VDU5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SnrkQ8VDU5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SnrkQ8VDU5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SnrkQ8VDU5 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SnrkQ8VDU5 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SnrkQ8VDU5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SnrkQ8VDU5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SnrkQ8VDU5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SnrkQ8VDU5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SnrkQ8VDU5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SnrkQ8VDU5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SnrkQ8VDU5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SnrkQ8VDU5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SnrkQ8VDU5 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SnrkQ8VDU5 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SnrkQ8VDU5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SnrkQ8VDU5 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SnrkQ8VDU5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SnrkQ8VDU5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SnrkQ8VDU5 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SnrkQ8VDU5 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SnrkQ8VDU5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SnrkQ8VDU5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms