Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubxn4Q8VCH8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ubxn4Q8VCH8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ubxn4Q8VCH8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ubxn4Q8VCH8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ubxn4Q8VCH8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubxn4Q8VCH8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubxn4Q8VCH8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubxn4Q8VCH8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubxn4Q8VCH8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubxn4Q8VCH8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubxn4Q8VCH8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubxn4Q8VCH8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubxn4Q8VCH8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubxn4Q8VCH8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubxn4Q8VCH8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubxn4Q8VCH8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubxn4Q8VCH8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubxn4Q8VCH8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubxn4Q8VCH8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubxn4Q8VCH8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubxn4Q8VCH8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubxn4Q8VCH8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubxn4Q8VCH8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubxn4Q8VCH8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubxn4Q8VCH8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubxn4Q8VCH8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubxn4Q8VCH8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubxn4Q8VCH8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubxn4Q8VCH8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ubxn4Q8VCH8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ubxn4Q8VCH8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ubxn4Q8VCH8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ubxn4Q8VCH8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ubxn4Q8VCH8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ubxn4Q8VCH8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ubxn4Q8VCH8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ubxn4Q8VCH8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ubxn4Q8VCH8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ubxn4Q8VCH8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ubxn4Q8VCH8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ubxn4Q8VCH8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Ubxn4Q8VCH8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ubxn4Q8VCH8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ubxn4Q8VCH8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ubxn4Q8VCH8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ubxn4Q8VCH8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ubxn4Q8VCH8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ubxn4Q8VCH8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ubxn4Q8VCH8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ubxn4Q8VCH8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ubxn4Q8VCH8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ubxn4Q8VCH8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ubxn4Q8VCH8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ubxn4Q8VCH8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ubxn4Q8VCH8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ubxn4Q8VCH8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ubxn4Q8VCH8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ubxn4Q8VCH8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ubxn4Q8VCH8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ubxn4Q8VCH8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ubxn4Q8VCH8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ubxn4Q8VCH8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ubxn4Q8VCH8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ubxn4Q8VCH8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ubxn4Q8VCH8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ubxn4Q8VCH8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ubxn4Q8VCH8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ubxn4Q8VCH8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ubxn4Q8VCH8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ubxn4Q8VCH8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ubxn4Q8VCH8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ubxn4Q8VCH8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ubxn4Q8VCH8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ubxn4Q8VCH8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ubxn4Q8VCH8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ubxn4Q8VCH8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ubxn4Q8VCH8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ubxn4Q8VCH8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ubxn4Q8VCH8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ubxn4Q8VCH8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ubxn4Q8VCH8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ubxn4Q8VCH8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ubxn4Q8VCH8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ubxn4Q8VCH8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ubxn4Q8VCH8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ubxn4Q8VCH8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ubxn4Q8VCH8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ubxn4Q8VCH8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ubxn4Q8VCH8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ubxn4Q8VCH8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ubxn4Q8VCH8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ubxn4Q8VCH8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ubxn4Q8VCH8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ubxn4Q8VCH8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ubxn4Q8VCH8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ubxn4Q8VCH8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ubxn4Q8VCH8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ubxn4Q8VCH8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ubxn4Q8VCH8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms