Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim29Q8R2Q0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim29Q8R2Q0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim29Q8R2Q0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim29Q8R2Q0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim29Q8R2Q0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim29Q8R2Q0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim29Q8R2Q0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim29Q8R2Q0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim29Q8R2Q0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim29Q8R2Q0 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim29Q8R2Q0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim29Q8R2Q0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim29Q8R2Q0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim29Q8R2Q0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim29Q8R2Q0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim29Q8R2Q0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim29Q8R2Q0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim29Q8R2Q0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim29Q8R2Q0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim29Q8R2Q0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim29Q8R2Q0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim29Q8R2Q0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim29Q8R2Q0 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim29Q8R2Q0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim29Q8R2Q0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim29Q8R2Q0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim29Q8R2Q0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim29Q8R2Q0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim29Q8R2Q0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim29Q8R2Q0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim29Q8R2Q0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim29Q8R2Q0 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim29Q8R2Q0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim29Q8R2Q0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim29Q8R2Q0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim29Q8R2Q0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim29Q8R2Q0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim29Q8R2Q0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim29Q8R2Q0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim29Q8R2Q0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim29Q8R2Q0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim29Q8R2Q0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim29Q8R2Q0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim29Q8R2Q0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim29Q8R2Q0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim29Q8R2Q0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim29Q8R2Q0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim29Q8R2Q0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim29Q8R2Q0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim29Q8R2Q0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim29Q8R2Q0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim29Q8R2Q0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim29Q8R2Q0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim29Q8R2Q0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim29Q8R2Q0 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim29Q8R2Q0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim29Q8R2Q0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Trim29Q8R2Q0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Trim29Q8R2Q0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Trim29Q8R2Q0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Trim29Q8R2Q0 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim29Q8R2Q0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim29Q8R2Q0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim29Q8R2Q0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim29Q8R2Q0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim29Q8R2Q0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim29Q8R2Q0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim29Q8R2Q0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim29Q8R2Q0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim29Q8R2Q0 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim29Q8R2Q0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim29Q8R2Q0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim29Q8R2Q0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim29Q8R2Q0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim29Q8R2Q0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim29Q8R2Q0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim29Q8R2Q0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim29Q8R2Q0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim29Q8R2Q0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim29Q8R2Q0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim29Q8R2Q0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim29Q8R2Q0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim29Q8R2Q0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim29Q8R2Q0 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim29Q8R2Q0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim29Q8R2Q0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim29Q8R2Q0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim29Q8R2Q0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim29Q8R2Q0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim29Q8R2Q0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim29Q8R2Q0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim29Q8R2Q0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim29Q8R2Q0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim29Q8R2Q0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim29Q8R2Q0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim29Q8R2Q0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim29Q8R2Q0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim29Q8R2Q0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim29Q8R2Q0 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms