Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZT2

Ccsap, Centriole, cilia and spindle-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcsapQ8QZT2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CcsapQ8QZT2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CcsapQ8QZT2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CcsapQ8QZT2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CcsapQ8QZT2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CcsapQ8QZT2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CcsapQ8QZT2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CcsapQ8QZT2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CcsapQ8QZT2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CcsapQ8QZT2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CcsapQ8QZT2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CcsapQ8QZT2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CcsapQ8QZT2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CcsapQ8QZT2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CcsapQ8QZT2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CcsapQ8QZT2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CcsapQ8QZT2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CcsapQ8QZT2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CcsapQ8QZT2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CcsapQ8QZT2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CcsapQ8QZT2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CcsapQ8QZT2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CcsapQ8QZT2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CcsapQ8QZT2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CcsapQ8QZT2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CcsapQ8QZT2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CcsapQ8QZT2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CcsapQ8QZT2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CcsapQ8QZT2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CcsapQ8QZT2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CcsapQ8QZT2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CcsapQ8QZT2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CcsapQ8QZT2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CcsapQ8QZT2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CcsapQ8QZT2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CcsapQ8QZT2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CcsapQ8QZT2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CcsapQ8QZT2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CcsapQ8QZT2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CcsapQ8QZT2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CcsapQ8QZT2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CcsapQ8QZT2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CcsapQ8QZT2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CcsapQ8QZT2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CcsapQ8QZT2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CcsapQ8QZT2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CcsapQ8QZT2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CcsapQ8QZT2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CcsapQ8QZT2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CcsapQ8QZT2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CcsapQ8QZT2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CcsapQ8QZT2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CcsapQ8QZT2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CcsapQ8QZT2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CcsapQ8QZT2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CcsapQ8QZT2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CcsapQ8QZT2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CcsapQ8QZT2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CcsapQ8QZT2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CcsapQ8QZT2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CcsapQ8QZT2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CcsapQ8QZT2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CcsapQ8QZT2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CcsapQ8QZT2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CcsapQ8QZT2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CcsapQ8QZT2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CcsapQ8QZT2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CcsapQ8QZT2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CcsapQ8QZT2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CcsapQ8QZT2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CcsapQ8QZT2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CcsapQ8QZT2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CcsapQ8QZT2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CcsapQ8QZT2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CcsapQ8QZT2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CcsapQ8QZT2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CcsapQ8QZT2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CcsapQ8QZT2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CcsapQ8QZT2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CcsapQ8QZT2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CcsapQ8QZT2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CcsapQ8QZT2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CcsapQ8QZT2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CcsapQ8QZT2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CcsapQ8QZT2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CcsapQ8QZT2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CcsapQ8QZT2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CcsapQ8QZT2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CcsapQ8QZT2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CcsapQ8QZT2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CcsapQ8QZT2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CcsapQ8QZT2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CcsapQ8QZT2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CcsapQ8QZT2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CcsapQ8QZT2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CcsapQ8QZT2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CcsapQ8QZT2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CcsapQ8QZT2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CcsapQ8QZT2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CcsapQ8QZT2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms