Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Q3

Foxn4, Forkhead box protein N4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxn4Q8K3Q3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxn4Q8K3Q3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxn4Q8K3Q3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxn4Q8K3Q3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxn4Q8K3Q3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxn4Q8K3Q3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxn4Q8K3Q3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxn4Q8K3Q3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxn4Q8K3Q3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxn4Q8K3Q3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxn4Q8K3Q3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxn4Q8K3Q3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxn4Q8K3Q3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxn4Q8K3Q3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxn4Q8K3Q3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxn4Q8K3Q3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Foxn4Q8K3Q3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Foxn4Q8K3Q3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Foxn4Q8K3Q3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Foxn4Q8K3Q3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Foxn4Q8K3Q3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxn4Q8K3Q3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxn4Q8K3Q3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxn4Q8K3Q3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxn4Q8K3Q3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxn4Q8K3Q3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxn4Q8K3Q3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxn4Q8K3Q3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxn4Q8K3Q3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxn4Q8K3Q3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxn4Q8K3Q3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxn4Q8K3Q3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxn4Q8K3Q3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxn4Q8K3Q3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxn4Q8K3Q3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxn4Q8K3Q3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxn4Q8K3Q3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxn4Q8K3Q3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxn4Q8K3Q3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxn4Q8K3Q3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxn4Q8K3Q3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxn4Q8K3Q3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxn4Q8K3Q3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxn4Q8K3Q3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxn4Q8K3Q3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxn4Q8K3Q3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxn4Q8K3Q3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxn4Q8K3Q3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxn4Q8K3Q3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxn4Q8K3Q3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxn4Q8K3Q3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxn4Q8K3Q3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxn4Q8K3Q3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxn4Q8K3Q3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxn4Q8K3Q3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxn4Q8K3Q3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxn4Q8K3Q3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxn4Q8K3Q3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxn4Q8K3Q3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxn4Q8K3Q3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxn4Q8K3Q3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxn4Q8K3Q3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxn4Q8K3Q3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxn4Q8K3Q3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxn4Q8K3Q3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxn4Q8K3Q3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxn4Q8K3Q3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxn4Q8K3Q3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxn4Q8K3Q3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxn4Q8K3Q3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxn4Q8K3Q3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxn4Q8K3Q3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxn4Q8K3Q3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxn4Q8K3Q3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxn4Q8K3Q3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxn4Q8K3Q3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxn4Q8K3Q3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxn4Q8K3Q3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxn4Q8K3Q3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxn4Q8K3Q3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxn4Q8K3Q3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxn4Q8K3Q3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxn4Q8K3Q3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxn4Q8K3Q3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxn4Q8K3Q3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxn4Q8K3Q3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxn4Q8K3Q3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxn4Q8K3Q3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxn4Q8K3Q3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxn4Q8K3Q3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxn4Q8K3Q3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxn4Q8K3Q3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxn4Q8K3Q3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxn4Q8K3Q3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxn4Q8K3Q3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxn4Q8K3Q3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxn4Q8K3Q3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxn4Q8K3Q3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxn4Q8K3Q3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxn4Q8K3Q3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms