Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prpf39Q8K2Z2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prpf39Q8K2Z2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prpf39Q8K2Z2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prpf39Q8K2Z2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prpf39Q8K2Z2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prpf39Q8K2Z2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prpf39Q8K2Z2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prpf39Q8K2Z2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prpf39Q8K2Z2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prpf39Q8K2Z2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Prpf39Q8K2Z2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prpf39Q8K2Z2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prpf39Q8K2Z2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prpf39Q8K2Z2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prpf39Q8K2Z2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prpf39Q8K2Z2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prpf39Q8K2Z2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prpf39Q8K2Z2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prpf39Q8K2Z2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prpf39Q8K2Z2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prpf39Q8K2Z2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prpf39Q8K2Z2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prpf39Q8K2Z2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prpf39Q8K2Z2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Prpf39Q8K2Z2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prpf39Q8K2Z2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Prpf39Q8K2Z2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Prpf39Q8K2Z2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prpf39Q8K2Z2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prpf39Q8K2Z2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prpf39Q8K2Z2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prpf39Q8K2Z2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Prpf39Q8K2Z2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prpf39Q8K2Z2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prpf39Q8K2Z2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prpf39Q8K2Z2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prpf39Q8K2Z2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prpf39Q8K2Z2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prpf39Q8K2Z2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prpf39Q8K2Z2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prpf39Q8K2Z2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prpf39Q8K2Z2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prpf39Q8K2Z2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prpf39Q8K2Z2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prpf39Q8K2Z2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prpf39Q8K2Z2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prpf39Q8K2Z2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prpf39Q8K2Z2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prpf39Q8K2Z2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prpf39Q8K2Z2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Prpf39Q8K2Z2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Prpf39Q8K2Z2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Prpf39Q8K2Z2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prpf39Q8K2Z2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prpf39Q8K2Z2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prpf39Q8K2Z2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prpf39Q8K2Z2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prpf39Q8K2Z2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prpf39Q8K2Z2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prpf39Q8K2Z2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prpf39Q8K2Z2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prpf39Q8K2Z2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prpf39Q8K2Z2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Prpf39Q8K2Z2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prpf39Q8K2Z2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prpf39Q8K2Z2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prpf39Q8K2Z2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prpf39Q8K2Z2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prpf39Q8K2Z2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prpf39Q8K2Z2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prpf39Q8K2Z2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prpf39Q8K2Z2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prpf39Q8K2Z2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prpf39Q8K2Z2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prpf39Q8K2Z2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prpf39Q8K2Z2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prpf39Q8K2Z2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prpf39Q8K2Z2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prpf39Q8K2Z2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prpf39Q8K2Z2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prpf39Q8K2Z2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prpf39Q8K2Z2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prpf39Q8K2Z2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prpf39Q8K2Z2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prpf39Q8K2Z2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prpf39Q8K2Z2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prpf39Q8K2Z2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prpf39Q8K2Z2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prpf39Q8K2Z2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prpf39Q8K2Z2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prpf39Q8K2Z2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Prpf39Q8K2Z2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prpf39Q8K2Z2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prpf39Q8K2Z2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prpf39Q8K2Z2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Prpf39Q8K2Z2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prpf39Q8K2Z2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prpf39Q8K2Z2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prpf39Q8K2Z2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms