Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2M3

Srrd, SRR1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrdQ8K2M3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SrrdQ8K2M3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SrrdQ8K2M3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SrrdQ8K2M3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SrrdQ8K2M3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SrrdQ8K2M3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SrrdQ8K2M3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SrrdQ8K2M3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SrrdQ8K2M3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SrrdQ8K2M3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SrrdQ8K2M3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SrrdQ8K2M3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SrrdQ8K2M3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SrrdQ8K2M3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SrrdQ8K2M3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SrrdQ8K2M3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SrrdQ8K2M3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SrrdQ8K2M3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SrrdQ8K2M3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SrrdQ8K2M3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SrrdQ8K2M3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SrrdQ8K2M3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SrrdQ8K2M3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SrrdQ8K2M3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SrrdQ8K2M3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SrrdQ8K2M3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SrrdQ8K2M3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SrrdQ8K2M3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SrrdQ8K2M3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SrrdQ8K2M3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SrrdQ8K2M3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SrrdQ8K2M3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SrrdQ8K2M3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SrrdQ8K2M3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SrrdQ8K2M3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SrrdQ8K2M3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SrrdQ8K2M3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SrrdQ8K2M3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SrrdQ8K2M3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SrrdQ8K2M3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SrrdQ8K2M3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SrrdQ8K2M3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SrrdQ8K2M3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SrrdQ8K2M3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SrrdQ8K2M3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18■□□□□ 0.47
SrrdQ8K2M3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SrrdQ8K2M3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SrrdQ8K2M3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SrrdQ8K2M3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SrrdQ8K2M3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SrrdQ8K2M3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SrrdQ8K2M3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SrrdQ8K2M3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SrrdQ8K2M3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SrrdQ8K2M3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SrrdQ8K2M3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SrrdQ8K2M3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SrrdQ8K2M3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SrrdQ8K2M3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SrrdQ8K2M3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SrrdQ8K2M3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SrrdQ8K2M3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SrrdQ8K2M3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrrdQ8K2M3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrrdQ8K2M3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrrdQ8K2M3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrrdQ8K2M3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrrdQ8K2M3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrrdQ8K2M3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrrdQ8K2M3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrrdQ8K2M3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrrdQ8K2M3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrrdQ8K2M3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrrdQ8K2M3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrrdQ8K2M3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrrdQ8K2M3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SrrdQ8K2M3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SrrdQ8K2M3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SrrdQ8K2M3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SrrdQ8K2M3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SrrdQ8K2M3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SrrdQ8K2M3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SrrdQ8K2M3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SrrdQ8K2M3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SrrdQ8K2M3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SrrdQ8K2M3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SrrdQ8K2M3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SrrdQ8K2M3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SrrdQ8K2M3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SrrdQ8K2M3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SrrdQ8K2M3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SrrdQ8K2M3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SrrdQ8K2M3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SrrdQ8K2M3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SrrdQ8K2M3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SrrdQ8K2M3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SrrdQ8K2M3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SrrdQ8K2M3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SrrdQ8K2M3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SrrdQ8K2M3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.4 ms