Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trappc12Q8K2L8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trappc12Q8K2L8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trappc12Q8K2L8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trappc12Q8K2L8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trappc12Q8K2L8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trappc12Q8K2L8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trappc12Q8K2L8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Trappc12Q8K2L8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trappc12Q8K2L8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Trappc12Q8K2L8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trappc12Q8K2L8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Trappc12Q8K2L8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trappc12Q8K2L8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trappc12Q8K2L8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trappc12Q8K2L8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trappc12Q8K2L8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trappc12Q8K2L8 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Trappc12Q8K2L8 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Trappc12Q8K2L8 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Trappc12Q8K2L8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trappc12Q8K2L8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trappc12Q8K2L8 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Trappc12Q8K2L8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Trappc12Q8K2L8 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Trappc12Q8K2L8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Trappc12Q8K2L8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trappc12Q8K2L8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trappc12Q8K2L8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trappc12Q8K2L8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trappc12Q8K2L8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trappc12Q8K2L8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Trappc12Q8K2L8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Trappc12Q8K2L8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trappc12Q8K2L8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trappc12Q8K2L8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trappc12Q8K2L8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trappc12Q8K2L8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trappc12Q8K2L8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trappc12Q8K2L8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trappc12Q8K2L8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trappc12Q8K2L8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trappc12Q8K2L8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trappc12Q8K2L8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trappc12Q8K2L8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trappc12Q8K2L8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trappc12Q8K2L8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trappc12Q8K2L8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trappc12Q8K2L8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trappc12Q8K2L8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trappc12Q8K2L8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trappc12Q8K2L8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trappc12Q8K2L8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trappc12Q8K2L8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trappc12Q8K2L8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trappc12Q8K2L8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trappc12Q8K2L8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trappc12Q8K2L8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trappc12Q8K2L8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Trappc12Q8K2L8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trappc12Q8K2L8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trappc12Q8K2L8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trappc12Q8K2L8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trappc12Q8K2L8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trappc12Q8K2L8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trappc12Q8K2L8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trappc12Q8K2L8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Trappc12Q8K2L8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trappc12Q8K2L8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trappc12Q8K2L8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trappc12Q8K2L8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trappc12Q8K2L8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trappc12Q8K2L8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trappc12Q8K2L8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Trappc12Q8K2L8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trappc12Q8K2L8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trappc12Q8K2L8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trappc12Q8K2L8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trappc12Q8K2L8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trappc12Q8K2L8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trappc12Q8K2L8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trappc12Q8K2L8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trappc12Q8K2L8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trappc12Q8K2L8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trappc12Q8K2L8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trappc12Q8K2L8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trappc12Q8K2L8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trappc12Q8K2L8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trappc12Q8K2L8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trappc12Q8K2L8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trappc12Q8K2L8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trappc12Q8K2L8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trappc12Q8K2L8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trappc12Q8K2L8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trappc12Q8K2L8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trappc12Q8K2L8 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Trappc12Q8K2L8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trappc12Q8K2L8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trappc12Q8K2L8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trappc12Q8K2L8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms