Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34c1Q8K193 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34c1Q8K193 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34c1Q8K193 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34c1Q8K193 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34c1Q8K193 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34c1Q8K193 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34c1Q8K193 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34c1Q8K193 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34c1Q8K193 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Cldn34c1Q8K193 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34c1Q8K193 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34c1Q8K193 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Cldn34c1Q8K193 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34c1Q8K193 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34c1Q8K193 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34c1Q8K193 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34c1Q8K193 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34c1Q8K193 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Cldn34c1Q8K193 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Cldn34c1Q8K193 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Cldn34c1Q8K193 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34c1Q8K193 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Cldn34c1Q8K193 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34c1Q8K193 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Cldn34c1Q8K193 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Cldn34c1Q8K193 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Cldn34c1Q8K193 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34c1Q8K193 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34c1Q8K193 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Cldn34c1Q8K193 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Cldn34c1Q8K193 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34c1Q8K193 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34c1Q8K193 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Cldn34c1Q8K193 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34c1Q8K193 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34c1Q8K193 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Cldn34c1Q8K193 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Cldn34c1Q8K193 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34c1Q8K193 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34c1Q8K193 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34c1Q8K193 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34c1Q8K193 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34c1Q8K193 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34c1Q8K193 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34c1Q8K193 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34c1Q8K193 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34c1Q8K193 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34c1Q8K193 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34c1Q8K193 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34c1Q8K193 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn34c1Q8K193 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn34c1Q8K193 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn34c1Q8K193 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn34c1Q8K193 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn34c1Q8K193 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn34c1Q8K193 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn34c1Q8K193 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn34c1Q8K193 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn34c1Q8K193 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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