Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0T0

Rtn1, Reticulon-1, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn1Q8K0T0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rtn1Q8K0T0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rtn1Q8K0T0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rtn1Q8K0T0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rtn1Q8K0T0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rtn1Q8K0T0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rtn1Q8K0T0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rtn1Q8K0T0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rtn1Q8K0T0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rtn1Q8K0T0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rtn1Q8K0T0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Rtn1Q8K0T0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rtn1Q8K0T0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rtn1Q8K0T0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rtn1Q8K0T0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rtn1Q8K0T0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rtn1Q8K0T0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rtn1Q8K0T0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Rtn1Q8K0T0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rtn1Q8K0T0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rtn1Q8K0T0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rtn1Q8K0T0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rtn1Q8K0T0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rtn1Q8K0T0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rtn1Q8K0T0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rtn1Q8K0T0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rtn1Q8K0T0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rtn1Q8K0T0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rtn1Q8K0T0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rtn1Q8K0T0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rtn1Q8K0T0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Rtn1Q8K0T0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rtn1Q8K0T0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rtn1Q8K0T0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rtn1Q8K0T0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rtn1Q8K0T0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rtn1Q8K0T0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rtn1Q8K0T0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rtn1Q8K0T0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rtn1Q8K0T0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rtn1Q8K0T0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rtn1Q8K0T0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rtn1Q8K0T0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rtn1Q8K0T0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rtn1Q8K0T0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rtn1Q8K0T0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rtn1Q8K0T0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rtn1Q8K0T0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rtn1Q8K0T0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rtn1Q8K0T0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rtn1Q8K0T0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rtn1Q8K0T0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rtn1Q8K0T0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rtn1Q8K0T0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rtn1Q8K0T0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rtn1Q8K0T0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Rtn1Q8K0T0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rtn1Q8K0T0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Rtn1Q8K0T0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rtn1Q8K0T0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rtn1Q8K0T0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rtn1Q8K0T0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rtn1Q8K0T0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rtn1Q8K0T0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rtn1Q8K0T0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rtn1Q8K0T0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rtn1Q8K0T0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rtn1Q8K0T0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rtn1Q8K0T0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rtn1Q8K0T0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rtn1Q8K0T0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rtn1Q8K0T0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rtn1Q8K0T0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rtn1Q8K0T0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rtn1Q8K0T0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rtn1Q8K0T0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rtn1Q8K0T0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rtn1Q8K0T0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rtn1Q8K0T0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rtn1Q8K0T0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rtn1Q8K0T0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rtn1Q8K0T0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rtn1Q8K0T0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rtn1Q8K0T0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rtn1Q8K0T0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rtn1Q8K0T0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rtn1Q8K0T0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rtn1Q8K0T0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rtn1Q8K0T0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rtn1Q8K0T0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rtn1Q8K0T0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rtn1Q8K0T0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rtn1Q8K0T0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rtn1Q8K0T0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rtn1Q8K0T0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rtn1Q8K0T0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rtn1Q8K0T0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rtn1Q8K0T0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rtn1Q8K0T0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rtn1Q8K0T0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms