Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pkn3Q8K045 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pkn3Q8K045 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pkn3Q8K045 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pkn3Q8K045 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pkn3Q8K045 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pkn3Q8K045 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pkn3Q8K045 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pkn3Q8K045 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pkn3Q8K045 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pkn3Q8K045 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pkn3Q8K045 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pkn3Q8K045 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pkn3Q8K045 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pkn3Q8K045 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pkn3Q8K045 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pkn3Q8K045 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pkn3Q8K045 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pkn3Q8K045 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pkn3Q8K045 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pkn3Q8K045 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pkn3Q8K045 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pkn3Q8K045 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pkn3Q8K045 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pkn3Q8K045 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pkn3Q8K045 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pkn3Q8K045 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pkn3Q8K045 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pkn3Q8K045 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pkn3Q8K045 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pkn3Q8K045 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pkn3Q8K045 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pkn3Q8K045 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pkn3Q8K045 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pkn3Q8K045 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pkn3Q8K045 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pkn3Q8K045 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pkn3Q8K045 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pkn3Q8K045 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pkn3Q8K045 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Pkn3Q8K045 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pkn3Q8K045 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pkn3Q8K045 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pkn3Q8K045 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pkn3Q8K045 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pkn3Q8K045 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pkn3Q8K045 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pkn3Q8K045 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pkn3Q8K045 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pkn3Q8K045 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pkn3Q8K045 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pkn3Q8K045 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pkn3Q8K045 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pkn3Q8K045 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pkn3Q8K045 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pkn3Q8K045 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pkn3Q8K045 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pkn3Q8K045 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pkn3Q8K045 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pkn3Q8K045 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pkn3Q8K045 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pkn3Q8K045 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pkn3Q8K045 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pkn3Q8K045 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pkn3Q8K045 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pkn3Q8K045 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pkn3Q8K045 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pkn3Q8K045 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pkn3Q8K045 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pkn3Q8K045 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pkn3Q8K045 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pkn3Q8K045 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pkn3Q8K045 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pkn3Q8K045 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pkn3Q8K045 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pkn3Q8K045 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pkn3Q8K045 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pkn3Q8K045 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Pkn3Q8K045 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pkn3Q8K045 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pkn3Q8K045 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pkn3Q8K045 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pkn3Q8K045 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pkn3Q8K045 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pkn3Q8K045 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pkn3Q8K045 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pkn3Q8K045 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pkn3Q8K045 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pkn3Q8K045 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pkn3Q8K045 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pkn3Q8K045 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pkn3Q8K045 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pkn3Q8K045 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pkn3Q8K045 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pkn3Q8K045 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Pkn3Q8K045 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pkn3Q8K045 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pkn3Q8K045 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pkn3Q8K045 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pkn3Q8K045 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms