Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZX4

Rbm17, Splicing factor 45, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm17Q8JZX4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Rbm17Q8JZX4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rbm17Q8JZX4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rbm17Q8JZX4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rbm17Q8JZX4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rbm17Q8JZX4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rbm17Q8JZX4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rbm17Q8JZX4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rbm17Q8JZX4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rbm17Q8JZX4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rbm17Q8JZX4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rbm17Q8JZX4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rbm17Q8JZX4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rbm17Q8JZX4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rbm17Q8JZX4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rbm17Q8JZX4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Rbm17Q8JZX4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rbm17Q8JZX4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rbm17Q8JZX4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rbm17Q8JZX4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Rbm17Q8JZX4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rbm17Q8JZX4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rbm17Q8JZX4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rbm17Q8JZX4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rbm17Q8JZX4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rbm17Q8JZX4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rbm17Q8JZX4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rbm17Q8JZX4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rbm17Q8JZX4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rbm17Q8JZX4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rbm17Q8JZX4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rbm17Q8JZX4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rbm17Q8JZX4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rbm17Q8JZX4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Rbm17Q8JZX4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rbm17Q8JZX4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rbm17Q8JZX4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rbm17Q8JZX4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rbm17Q8JZX4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rbm17Q8JZX4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rbm17Q8JZX4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Rbm17Q8JZX4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rbm17Q8JZX4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rbm17Q8JZX4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rbm17Q8JZX4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rbm17Q8JZX4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rbm17Q8JZX4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rbm17Q8JZX4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rbm17Q8JZX4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rbm17Q8JZX4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rbm17Q8JZX4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rbm17Q8JZX4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rbm17Q8JZX4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rbm17Q8JZX4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rbm17Q8JZX4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rbm17Q8JZX4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rbm17Q8JZX4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rbm17Q8JZX4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rbm17Q8JZX4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rbm17Q8JZX4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Rbm17Q8JZX4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rbm17Q8JZX4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rbm17Q8JZX4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rbm17Q8JZX4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rbm17Q8JZX4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rbm17Q8JZX4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rbm17Q8JZX4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rbm17Q8JZX4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rbm17Q8JZX4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rbm17Q8JZX4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rbm17Q8JZX4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rbm17Q8JZX4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rbm17Q8JZX4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Rbm17Q8JZX4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rbm17Q8JZX4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rbm17Q8JZX4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rbm17Q8JZX4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rbm17Q8JZX4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rbm17Q8JZX4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rbm17Q8JZX4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rbm17Q8JZX4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rbm17Q8JZX4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rbm17Q8JZX4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rbm17Q8JZX4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rbm17Q8JZX4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rbm17Q8JZX4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rbm17Q8JZX4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rbm17Q8JZX4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rbm17Q8JZX4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rbm17Q8JZX4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rbm17Q8JZX4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rbm17Q8JZX4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rbm17Q8JZX4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Rbm17Q8JZX4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rbm17Q8JZX4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rbm17Q8JZX4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rbm17Q8JZX4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rbm17Q8JZX4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rbm17Q8JZX4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rbm17Q8JZX4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms