Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW8

Pnma3, Paraneoplastic antigen Ma3 homolog, mousemouse

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Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma3Q8JZW8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pnma3Q8JZW8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pnma3Q8JZW8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pnma3Q8JZW8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pnma3Q8JZW8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pnma3Q8JZW8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pnma3Q8JZW8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pnma3Q8JZW8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pnma3Q8JZW8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pnma3Q8JZW8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pnma3Q8JZW8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pnma3Q8JZW8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pnma3Q8JZW8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pnma3Q8JZW8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pnma3Q8JZW8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pnma3Q8JZW8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pnma3Q8JZW8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Pnma3Q8JZW8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pnma3Q8JZW8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pnma3Q8JZW8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pnma3Q8JZW8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Pnma3Q8JZW8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pnma3Q8JZW8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pnma3Q8JZW8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pnma3Q8JZW8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pnma3Q8JZW8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pnma3Q8JZW8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pnma3Q8JZW8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pnma3Q8JZW8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pnma3Q8JZW8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pnma3Q8JZW8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pnma3Q8JZW8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pnma3Q8JZW8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pnma3Q8JZW8 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pnma3Q8JZW8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pnma3Q8JZW8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pnma3Q8JZW8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pnma3Q8JZW8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pnma3Q8JZW8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pnma3Q8JZW8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pnma3Q8JZW8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pnma3Q8JZW8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pnma3Q8JZW8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pnma3Q8JZW8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pnma3Q8JZW8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pnma3Q8JZW8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pnma3Q8JZW8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pnma3Q8JZW8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pnma3Q8JZW8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pnma3Q8JZW8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pnma3Q8JZW8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pnma3Q8JZW8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pnma3Q8JZW8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pnma3Q8JZW8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pnma3Q8JZW8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pnma3Q8JZW8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pnma3Q8JZW8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pnma3Q8JZW8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pnma3Q8JZW8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pnma3Q8JZW8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pnma3Q8JZW8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pnma3Q8JZW8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pnma3Q8JZW8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Pnma3Q8JZW8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pnma3Q8JZW8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Pnma3Q8JZW8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pnma3Q8JZW8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pnma3Q8JZW8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pnma3Q8JZW8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pnma3Q8JZW8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pnma3Q8JZW8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pnma3Q8JZW8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pnma3Q8JZW8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pnma3Q8JZW8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pnma3Q8JZW8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pnma3Q8JZW8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pnma3Q8JZW8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pnma3Q8JZW8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pnma3Q8JZW8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pnma3Q8JZW8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pnma3Q8JZW8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pnma3Q8JZW8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pnma3Q8JZW8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pnma3Q8JZW8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pnma3Q8JZW8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pnma3Q8JZW8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pnma3Q8JZW8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pnma3Q8JZW8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pnma3Q8JZW8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pnma3Q8JZW8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pnma3Q8JZW8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pnma3Q8JZW8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pnma3Q8JZW8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pnma3Q8JZW8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pnma3Q8JZW8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pnma3Q8JZW8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pnma3Q8JZW8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pnma3Q8JZW8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pnma3Q8JZW8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pnma3Q8JZW8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms