Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW4

Cpne5, Copine-5, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne5Q8JZW4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cpne5Q8JZW4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cpne5Q8JZW4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cpne5Q8JZW4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cpne5Q8JZW4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cpne5Q8JZW4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cpne5Q8JZW4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cpne5Q8JZW4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cpne5Q8JZW4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cpne5Q8JZW4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cpne5Q8JZW4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cpne5Q8JZW4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cpne5Q8JZW4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cpne5Q8JZW4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cpne5Q8JZW4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cpne5Q8JZW4 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cpne5Q8JZW4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cpne5Q8JZW4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cpne5Q8JZW4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cpne5Q8JZW4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cpne5Q8JZW4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cpne5Q8JZW4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cpne5Q8JZW4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cpne5Q8JZW4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cpne5Q8JZW4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cpne5Q8JZW4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cpne5Q8JZW4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cpne5Q8JZW4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cpne5Q8JZW4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cpne5Q8JZW4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cpne5Q8JZW4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cpne5Q8JZW4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cpne5Q8JZW4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cpne5Q8JZW4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cpne5Q8JZW4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cpne5Q8JZW4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cpne5Q8JZW4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cpne5Q8JZW4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cpne5Q8JZW4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cpne5Q8JZW4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cpne5Q8JZW4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cpne5Q8JZW4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cpne5Q8JZW4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cpne5Q8JZW4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cpne5Q8JZW4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cpne5Q8JZW4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cpne5Q8JZW4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cpne5Q8JZW4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cpne5Q8JZW4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cpne5Q8JZW4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cpne5Q8JZW4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cpne5Q8JZW4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cpne5Q8JZW4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cpne5Q8JZW4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cpne5Q8JZW4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cpne5Q8JZW4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cpne5Q8JZW4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cpne5Q8JZW4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cpne5Q8JZW4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cpne5Q8JZW4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cpne5Q8JZW4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cpne5Q8JZW4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cpne5Q8JZW4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cpne5Q8JZW4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cpne5Q8JZW4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cpne5Q8JZW4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cpne5Q8JZW4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cpne5Q8JZW4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cpne5Q8JZW4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cpne5Q8JZW4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cpne5Q8JZW4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cpne5Q8JZW4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cpne5Q8JZW4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cpne5Q8JZW4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cpne5Q8JZW4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cpne5Q8JZW4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cpne5Q8JZW4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cpne5Q8JZW4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cpne5Q8JZW4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cpne5Q8JZW4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Cpne5Q8JZW4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cpne5Q8JZW4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cpne5Q8JZW4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cpne5Q8JZW4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cpne5Q8JZW4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cpne5Q8JZW4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cpne5Q8JZW4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cpne5Q8JZW4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cpne5Q8JZW4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cpne5Q8JZW4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cpne5Q8JZW4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cpne5Q8JZW4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cpne5Q8JZW4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cpne5Q8JZW4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cpne5Q8JZW4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cpne5Q8JZW4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cpne5Q8JZW4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cpne5Q8JZW4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cpne5Q8JZW4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cpne5Q8JZW4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms