Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZR6

Slc4a8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a8Q8JZR6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc4a8Q8JZR6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc4a8Q8JZR6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc4a8Q8JZR6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc4a8Q8JZR6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc4a8Q8JZR6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc4a8Q8JZR6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc4a8Q8JZR6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc4a8Q8JZR6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc4a8Q8JZR6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc4a8Q8JZR6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc4a8Q8JZR6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc4a8Q8JZR6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc4a8Q8JZR6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc4a8Q8JZR6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc4a8Q8JZR6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc4a8Q8JZR6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc4a8Q8JZR6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc4a8Q8JZR6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc4a8Q8JZR6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc4a8Q8JZR6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc4a8Q8JZR6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc4a8Q8JZR6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc4a8Q8JZR6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc4a8Q8JZR6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc4a8Q8JZR6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc4a8Q8JZR6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc4a8Q8JZR6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc4a8Q8JZR6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc4a8Q8JZR6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc4a8Q8JZR6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc4a8Q8JZR6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc4a8Q8JZR6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc4a8Q8JZR6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc4a8Q8JZR6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc4a8Q8JZR6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc4a8Q8JZR6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc4a8Q8JZR6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Slc4a8Q8JZR6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Slc4a8Q8JZR6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc4a8Q8JZR6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc4a8Q8JZR6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc4a8Q8JZR6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc4a8Q8JZR6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc4a8Q8JZR6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc4a8Q8JZR6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc4a8Q8JZR6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc4a8Q8JZR6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc4a8Q8JZR6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc4a8Q8JZR6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc4a8Q8JZR6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc4a8Q8JZR6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc4a8Q8JZR6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc4a8Q8JZR6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc4a8Q8JZR6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc4a8Q8JZR6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc4a8Q8JZR6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc4a8Q8JZR6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc4a8Q8JZR6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc4a8Q8JZR6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc4a8Q8JZR6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc4a8Q8JZR6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc4a8Q8JZR6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc4a8Q8JZR6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc4a8Q8JZR6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc4a8Q8JZR6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc4a8Q8JZR6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc4a8Q8JZR6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc4a8Q8JZR6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc4a8Q8JZR6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc4a8Q8JZR6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc4a8Q8JZR6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc4a8Q8JZR6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc4a8Q8JZR6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc4a8Q8JZR6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc4a8Q8JZR6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc4a8Q8JZR6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc4a8Q8JZR6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc4a8Q8JZR6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc4a8Q8JZR6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc4a8Q8JZR6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc4a8Q8JZR6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc4a8Q8JZR6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc4a8Q8JZR6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc4a8Q8JZR6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc4a8Q8JZR6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc4a8Q8JZR6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc4a8Q8JZR6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc4a8Q8JZR6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc4a8Q8JZR6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc4a8Q8JZR6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc4a8Q8JZR6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc4a8Q8JZR6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc4a8Q8JZR6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc4a8Q8JZR6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Slc4a8Q8JZR6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc4a8Q8JZR6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc4a8Q8JZR6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc4a8Q8JZR6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc4a8Q8JZR6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms