Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SbsnQ8CIT9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SbsnQ8CIT9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SbsnQ8CIT9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SbsnQ8CIT9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SbsnQ8CIT9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SbsnQ8CIT9 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SbsnQ8CIT9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SbsnQ8CIT9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SbsnQ8CIT9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SbsnQ8CIT9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SbsnQ8CIT9 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SbsnQ8CIT9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SbsnQ8CIT9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SbsnQ8CIT9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SbsnQ8CIT9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SbsnQ8CIT9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SbsnQ8CIT9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SbsnQ8CIT9 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SbsnQ8CIT9 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SbsnQ8CIT9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SbsnQ8CIT9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SbsnQ8CIT9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SbsnQ8CIT9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SbsnQ8CIT9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SbsnQ8CIT9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SbsnQ8CIT9 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SbsnQ8CIT9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SbsnQ8CIT9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SbsnQ8CIT9 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SbsnQ8CIT9 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SbsnQ8CIT9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SbsnQ8CIT9 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SbsnQ8CIT9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SbsnQ8CIT9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SbsnQ8CIT9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SbsnQ8CIT9 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SbsnQ8CIT9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SbsnQ8CIT9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SbsnQ8CIT9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SbsnQ8CIT9 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SbsnQ8CIT9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SbsnQ8CIT9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SbsnQ8CIT9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SbsnQ8CIT9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SbsnQ8CIT9 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SbsnQ8CIT9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SbsnQ8CIT9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SbsnQ8CIT9 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SbsnQ8CIT9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SbsnQ8CIT9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SbsnQ8CIT9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SbsnQ8CIT9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SbsnQ8CIT9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SbsnQ8CIT9 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SbsnQ8CIT9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SbsnQ8CIT9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SbsnQ8CIT9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SbsnQ8CIT9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SbsnQ8CIT9 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SbsnQ8CIT9 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SbsnQ8CIT9 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SbsnQ8CIT9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SbsnQ8CIT9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SbsnQ8CIT9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SbsnQ8CIT9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SbsnQ8CIT9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SbsnQ8CIT9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SbsnQ8CIT9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SbsnQ8CIT9 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SbsnQ8CIT9 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SbsnQ8CIT9 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SbsnQ8CIT9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SbsnQ8CIT9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SbsnQ8CIT9 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SbsnQ8CIT9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SbsnQ8CIT9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SbsnQ8CIT9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SbsnQ8CIT9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SbsnQ8CIT9 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SbsnQ8CIT9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SbsnQ8CIT9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SbsnQ8CIT9 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SbsnQ8CIT9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SbsnQ8CIT9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SbsnQ8CIT9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SbsnQ8CIT9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SbsnQ8CIT9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SbsnQ8CIT9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SbsnQ8CIT9 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SbsnQ8CIT9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SbsnQ8CIT9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SbsnQ8CIT9 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SbsnQ8CIT9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SbsnQ8CIT9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SbsnQ8CIT9 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SbsnQ8CIT9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SbsnQ8CIT9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SbsnQ8CIT9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SbsnQ8CIT9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms