Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIN6

Celf3, CUGBP Elav-like family member 3, mousemouse

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Celf3Q8CIN6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Celf3Q8CIN6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Celf3Q8CIN6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Celf3Q8CIN6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Celf3Q8CIN6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Celf3Q8CIN6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Celf3Q8CIN6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Celf3Q8CIN6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Celf3Q8CIN6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Celf3Q8CIN6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Celf3Q8CIN6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Celf3Q8CIN6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Celf3Q8CIN6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Celf3Q8CIN6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Celf3Q8CIN6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Celf3Q8CIN6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Celf3Q8CIN6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Celf3Q8CIN6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Celf3Q8CIN6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Celf3Q8CIN6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Celf3Q8CIN6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Celf3Q8CIN6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Celf3Q8CIN6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Celf3Q8CIN6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Celf3Q8CIN6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Celf3Q8CIN6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Celf3Q8CIN6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Celf3Q8CIN6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Celf3Q8CIN6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Celf3Q8CIN6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Celf3Q8CIN6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Celf3Q8CIN6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Celf3Q8CIN6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Celf3Q8CIN6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Celf3Q8CIN6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Celf3Q8CIN6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Celf3Q8CIN6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Celf3Q8CIN6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Celf3Q8CIN6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Celf3Q8CIN6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Celf3Q8CIN6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Celf3Q8CIN6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Celf3Q8CIN6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Celf3Q8CIN6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Celf3Q8CIN6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Celf3Q8CIN6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Celf3Q8CIN6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Celf3Q8CIN6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Celf3Q8CIN6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Celf3Q8CIN6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Celf3Q8CIN6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Celf3Q8CIN6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Celf3Q8CIN6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Celf3Q8CIN6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Celf3Q8CIN6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Celf3Q8CIN6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Celf3Q8CIN6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Celf3Q8CIN6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Celf3Q8CIN6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Celf3Q8CIN6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Celf3Q8CIN6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Celf3Q8CIN6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Celf3Q8CIN6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Celf3Q8CIN6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Celf3Q8CIN6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Celf3Q8CIN6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Celf3Q8CIN6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Celf3Q8CIN6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Celf3Q8CIN6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Celf3Q8CIN6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Celf3Q8CIN6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Celf3Q8CIN6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Celf3Q8CIN6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Celf3Q8CIN6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Celf3Q8CIN6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Celf3Q8CIN6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Celf3Q8CIN6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Celf3Q8CIN6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Celf3Q8CIN6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Celf3Q8CIN6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Celf3Q8CIN6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Celf3Q8CIN6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Celf3Q8CIN6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Celf3Q8CIN6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Celf3Q8CIN6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Celf3Q8CIN6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Celf3Q8CIN6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Celf3Q8CIN6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Celf3Q8CIN6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Celf3Q8CIN6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Celf3Q8CIN6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Celf3Q8CIN6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Celf3Q8CIN6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Celf3Q8CIN6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Celf3Q8CIN6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Celf3Q8CIN6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Celf3Q8CIN6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Celf3Q8CIN6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Celf3Q8CIN6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Celf3Q8CIN6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms