Protein–RNA interactions for Protein: Q8CII8

Syne4, Nesprin-4, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne4Q8CII8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Syne4Q8CII8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Syne4Q8CII8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Syne4Q8CII8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Syne4Q8CII8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Syne4Q8CII8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Syne4Q8CII8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Syne4Q8CII8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Syne4Q8CII8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Syne4Q8CII8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Syne4Q8CII8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Syne4Q8CII8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Syne4Q8CII8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Syne4Q8CII8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Syne4Q8CII8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Syne4Q8CII8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Syne4Q8CII8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Syne4Q8CII8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Syne4Q8CII8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Syne4Q8CII8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Syne4Q8CII8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Syne4Q8CII8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Syne4Q8CII8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Syne4Q8CII8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Syne4Q8CII8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Syne4Q8CII8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Syne4Q8CII8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Syne4Q8CII8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syne4Q8CII8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syne4Q8CII8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syne4Q8CII8 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Syne4Q8CII8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syne4Q8CII8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syne4Q8CII8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syne4Q8CII8 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Syne4Q8CII8 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Syne4Q8CII8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syne4Q8CII8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syne4Q8CII8 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Syne4Q8CII8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syne4Q8CII8 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Syne4Q8CII8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Syne4Q8CII8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syne4Q8CII8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syne4Q8CII8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syne4Q8CII8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syne4Q8CII8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syne4Q8CII8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syne4Q8CII8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syne4Q8CII8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syne4Q8CII8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Syne4Q8CII8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Syne4Q8CII8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Syne4Q8CII8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Syne4Q8CII8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Syne4Q8CII8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Syne4Q8CII8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Syne4Q8CII8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Syne4Q8CII8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Syne4Q8CII8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Syne4Q8CII8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Syne4Q8CII8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Syne4Q8CII8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Syne4Q8CII8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Syne4Q8CII8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Syne4Q8CII8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Syne4Q8CII8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Syne4Q8CII8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Syne4Q8CII8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Syne4Q8CII8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Syne4Q8CII8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Syne4Q8CII8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Syne4Q8CII8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Syne4Q8CII8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Syne4Q8CII8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Syne4Q8CII8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Syne4Q8CII8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Syne4Q8CII8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Syne4Q8CII8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Syne4Q8CII8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Syne4Q8CII8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Syne4Q8CII8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Syne4Q8CII8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Syne4Q8CII8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Syne4Q8CII8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Syne4Q8CII8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Syne4Q8CII8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Syne4Q8CII8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Syne4Q8CII8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Syne4Q8CII8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Syne4Q8CII8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Syne4Q8CII8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Syne4Q8CII8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Syne4Q8CII8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Syne4Q8CII8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Syne4Q8CII8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Syne4Q8CII8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Syne4Q8CII8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Syne4Q8CII8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Syne4Q8CII8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms