Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CopaQ8CIE6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CopaQ8CIE6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CopaQ8CIE6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CopaQ8CIE6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CopaQ8CIE6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CopaQ8CIE6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CopaQ8CIE6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CopaQ8CIE6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CopaQ8CIE6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CopaQ8CIE6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CopaQ8CIE6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CopaQ8CIE6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CopaQ8CIE6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CopaQ8CIE6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CopaQ8CIE6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CopaQ8CIE6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CopaQ8CIE6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CopaQ8CIE6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CopaQ8CIE6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CopaQ8CIE6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CopaQ8CIE6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CopaQ8CIE6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CopaQ8CIE6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CopaQ8CIE6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CopaQ8CIE6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CopaQ8CIE6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CopaQ8CIE6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CopaQ8CIE6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CopaQ8CIE6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CopaQ8CIE6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CopaQ8CIE6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CopaQ8CIE6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CopaQ8CIE6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CopaQ8CIE6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CopaQ8CIE6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CopaQ8CIE6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CopaQ8CIE6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CopaQ8CIE6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CopaQ8CIE6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CopaQ8CIE6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CopaQ8CIE6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
CopaQ8CIE6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CopaQ8CIE6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CopaQ8CIE6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CopaQ8CIE6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CopaQ8CIE6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CopaQ8CIE6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CopaQ8CIE6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CopaQ8CIE6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CopaQ8CIE6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CopaQ8CIE6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CopaQ8CIE6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CopaQ8CIE6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CopaQ8CIE6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CopaQ8CIE6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CopaQ8CIE6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CopaQ8CIE6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CopaQ8CIE6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CopaQ8CIE6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CopaQ8CIE6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CopaQ8CIE6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CopaQ8CIE6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CopaQ8CIE6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CopaQ8CIE6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CopaQ8CIE6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CopaQ8CIE6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CopaQ8CIE6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CopaQ8CIE6 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CopaQ8CIE6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CopaQ8CIE6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CopaQ8CIE6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CopaQ8CIE6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CopaQ8CIE6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CopaQ8CIE6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CopaQ8CIE6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CopaQ8CIE6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CopaQ8CIE6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CopaQ8CIE6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CopaQ8CIE6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CopaQ8CIE6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CopaQ8CIE6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CopaQ8CIE6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CopaQ8CIE6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CopaQ8CIE6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CopaQ8CIE6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CopaQ8CIE6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CopaQ8CIE6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CopaQ8CIE6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CopaQ8CIE6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CopaQ8CIE6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CopaQ8CIE6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CopaQ8CIE6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CopaQ8CIE6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CopaQ8CIE6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CopaQ8CIE6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CopaQ8CIE6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CopaQ8CIE6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CopaQ8CIE6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CopaQ8CIE6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms