Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH77

Nav1, Neuron navigator 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,875 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nav1Q8CH77 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Nav1Q8CH77 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Nav1Q8CH77 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nav1Q8CH77 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nav1Q8CH77 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nav1Q8CH77 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nav1Q8CH77 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nav1Q8CH77 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nav1Q8CH77 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nav1Q8CH77 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nav1Q8CH77 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nav1Q8CH77 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nav1Q8CH77 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nav1Q8CH77 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nav1Q8CH77 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nav1Q8CH77 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nav1Q8CH77 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nav1Q8CH77 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nav1Q8CH77 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nav1Q8CH77 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nav1Q8CH77 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nav1Q8CH77 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nav1Q8CH77 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nav1Q8CH77 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nav1Q8CH77 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nav1Q8CH77 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nav1Q8CH77 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nav1Q8CH77 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nav1Q8CH77 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nav1Q8CH77 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Nav1Q8CH77 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nav1Q8CH77 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nav1Q8CH77 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nav1Q8CH77 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nav1Q8CH77 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nav1Q8CH77 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nav1Q8CH77 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nav1Q8CH77 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nav1Q8CH77 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nav1Q8CH77 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nav1Q8CH77 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nav1Q8CH77 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nav1Q8CH77 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nav1Q8CH77 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nav1Q8CH77 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Nav1Q8CH77 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Nav1Q8CH77 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Nav1Q8CH77 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Nav1Q8CH77 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Nav1Q8CH77 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nav1Q8CH77 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nav1Q8CH77 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nav1Q8CH77 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nav1Q8CH77 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nav1Q8CH77 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nav1Q8CH77 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nav1Q8CH77 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nav1Q8CH77 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nav1Q8CH77 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nav1Q8CH77 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nav1Q8CH77 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nav1Q8CH77 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nav1Q8CH77 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nav1Q8CH77 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nav1Q8CH77 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nav1Q8CH77 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nav1Q8CH77 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nav1Q8CH77 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nav1Q8CH77 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nav1Q8CH77 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Nav1Q8CH77 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nav1Q8CH77 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nav1Q8CH77 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nav1Q8CH77 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nav1Q8CH77 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nav1Q8CH77 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nav1Q8CH77 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nav1Q8CH77 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Nav1Q8CH77 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nav1Q8CH77 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nav1Q8CH77 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nav1Q8CH77 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Nav1Q8CH77 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nav1Q8CH77 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nav1Q8CH77 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nav1Q8CH77 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nav1Q8CH77 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nav1Q8CH77 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nav1Q8CH77 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nav1Q8CH77 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nav1Q8CH77 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Nav1Q8CH77 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nav1Q8CH77 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nav1Q8CH77 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nav1Q8CH77 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nav1Q8CH77 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nav1Q8CH77 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nav1Q8CH77 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nav1Q8CH77 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nav1Q8CH77 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms