Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Upp2Q8CGR7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Upp2Q8CGR7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Upp2Q8CGR7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Upp2Q8CGR7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Upp2Q8CGR7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Upp2Q8CGR7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Upp2Q8CGR7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Upp2Q8CGR7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Upp2Q8CGR7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Upp2Q8CGR7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Upp2Q8CGR7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Upp2Q8CGR7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Upp2Q8CGR7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Upp2Q8CGR7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Upp2Q8CGR7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Upp2Q8CGR7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Upp2Q8CGR7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Upp2Q8CGR7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Upp2Q8CGR7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Upp2Q8CGR7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Upp2Q8CGR7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Upp2Q8CGR7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Upp2Q8CGR7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Upp2Q8CGR7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Upp2Q8CGR7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Upp2Q8CGR7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Upp2Q8CGR7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Upp2Q8CGR7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Upp2Q8CGR7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Upp2Q8CGR7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Upp2Q8CGR7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Upp2Q8CGR7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Upp2Q8CGR7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Upp2Q8CGR7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Upp2Q8CGR7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Upp2Q8CGR7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Upp2Q8CGR7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Upp2Q8CGR7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Upp2Q8CGR7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Upp2Q8CGR7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Upp2Q8CGR7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Upp2Q8CGR7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Upp2Q8CGR7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Upp2Q8CGR7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Upp2Q8CGR7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Upp2Q8CGR7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Upp2Q8CGR7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Upp2Q8CGR7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Upp2Q8CGR7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Upp2Q8CGR7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Upp2Q8CGR7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Upp2Q8CGR7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Upp2Q8CGR7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Upp2Q8CGR7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Upp2Q8CGR7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Upp2Q8CGR7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Upp2Q8CGR7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Upp2Q8CGR7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Upp2Q8CGR7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Upp2Q8CGR7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Upp2Q8CGR7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Upp2Q8CGR7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Upp2Q8CGR7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Upp2Q8CGR7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Upp2Q8CGR7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Upp2Q8CGR7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Upp2Q8CGR7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Upp2Q8CGR7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Upp2Q8CGR7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Upp2Q8CGR7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Upp2Q8CGR7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Upp2Q8CGR7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Upp2Q8CGR7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Upp2Q8CGR7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Upp2Q8CGR7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Upp2Q8CGR7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Upp2Q8CGR7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Upp2Q8CGR7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Upp2Q8CGR7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Upp2Q8CGR7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Upp2Q8CGR7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Upp2Q8CGR7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Upp2Q8CGR7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Upp2Q8CGR7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Upp2Q8CGR7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Upp2Q8CGR7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Upp2Q8CGR7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Upp2Q8CGR7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Upp2Q8CGR7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Upp2Q8CGR7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Upp2Q8CGR7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Upp2Q8CGR7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Upp2Q8CGR7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Upp2Q8CGR7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Upp2Q8CGR7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Upp2Q8CGR7 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Upp2Q8CGR7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Upp2Q8CGR7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Upp2Q8CGR7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms