Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFA7

Klf17, Krueppel-like factor 17, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf17Q8CFA7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klf17Q8CFA7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Klf17Q8CFA7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Klf17Q8CFA7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klf17Q8CFA7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klf17Q8CFA7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klf17Q8CFA7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klf17Q8CFA7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klf17Q8CFA7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klf17Q8CFA7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klf17Q8CFA7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klf17Q8CFA7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klf17Q8CFA7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klf17Q8CFA7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klf17Q8CFA7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klf17Q8CFA7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klf17Q8CFA7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klf17Q8CFA7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Klf17Q8CFA7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Klf17Q8CFA7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klf17Q8CFA7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klf17Q8CFA7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klf17Q8CFA7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klf17Q8CFA7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klf17Q8CFA7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klf17Q8CFA7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klf17Q8CFA7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klf17Q8CFA7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klf17Q8CFA7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klf17Q8CFA7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klf17Q8CFA7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klf17Q8CFA7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klf17Q8CFA7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klf17Q8CFA7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klf17Q8CFA7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klf17Q8CFA7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klf17Q8CFA7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klf17Q8CFA7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klf17Q8CFA7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klf17Q8CFA7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klf17Q8CFA7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klf17Q8CFA7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klf17Q8CFA7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Klf17Q8CFA7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klf17Q8CFA7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klf17Q8CFA7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klf17Q8CFA7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klf17Q8CFA7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klf17Q8CFA7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klf17Q8CFA7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klf17Q8CFA7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klf17Q8CFA7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klf17Q8CFA7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klf17Q8CFA7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klf17Q8CFA7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klf17Q8CFA7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klf17Q8CFA7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klf17Q8CFA7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klf17Q8CFA7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klf17Q8CFA7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klf17Q8CFA7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klf17Q8CFA7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klf17Q8CFA7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klf17Q8CFA7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klf17Q8CFA7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Klf17Q8CFA7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klf17Q8CFA7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klf17Q8CFA7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klf17Q8CFA7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klf17Q8CFA7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klf17Q8CFA7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klf17Q8CFA7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klf17Q8CFA7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klf17Q8CFA7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klf17Q8CFA7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klf17Q8CFA7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klf17Q8CFA7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klf17Q8CFA7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Klf17Q8CFA7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klf17Q8CFA7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klf17Q8CFA7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klf17Q8CFA7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klf17Q8CFA7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klf17Q8CFA7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Klf17Q8CFA7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Klf17Q8CFA7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Klf17Q8CFA7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klf17Q8CFA7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Klf17Q8CFA7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klf17Q8CFA7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Klf17Q8CFA7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klf17Q8CFA7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klf17Q8CFA7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klf17Q8CFA7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klf17Q8CFA7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klf17Q8CFA7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Klf17Q8CFA7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klf17Q8CFA7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klf17Q8CFA7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klf17Q8CFA7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.6 ms