Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cdkl1Q8CEQ0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdkl1Q8CEQ0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdkl1Q8CEQ0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdkl1Q8CEQ0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdkl1Q8CEQ0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdkl1Q8CEQ0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms