Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCN5

Bcas3, Breast carcinoma-amplified sequence 3 homolog, mousemouse

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Length 928 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcas3Q8CCN5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bcas3Q8CCN5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bcas3Q8CCN5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bcas3Q8CCN5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bcas3Q8CCN5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bcas3Q8CCN5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bcas3Q8CCN5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bcas3Q8CCN5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bcas3Q8CCN5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bcas3Q8CCN5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bcas3Q8CCN5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bcas3Q8CCN5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bcas3Q8CCN5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bcas3Q8CCN5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bcas3Q8CCN5 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Bcas3Q8CCN5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bcas3Q8CCN5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bcas3Q8CCN5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bcas3Q8CCN5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bcas3Q8CCN5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bcas3Q8CCN5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bcas3Q8CCN5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bcas3Q8CCN5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bcas3Q8CCN5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bcas3Q8CCN5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bcas3Q8CCN5 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Bcas3Q8CCN5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bcas3Q8CCN5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bcas3Q8CCN5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bcas3Q8CCN5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bcas3Q8CCN5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bcas3Q8CCN5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bcas3Q8CCN5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bcas3Q8CCN5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Bcas3Q8CCN5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bcas3Q8CCN5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bcas3Q8CCN5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bcas3Q8CCN5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bcas3Q8CCN5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bcas3Q8CCN5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Bcas3Q8CCN5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bcas3Q8CCN5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Bcas3Q8CCN5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Bcas3Q8CCN5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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Bcas3Q8CCN5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Bcas3Q8CCN5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Bcas3Q8CCN5 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Bcas3Q8CCN5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Bcas3Q8CCN5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Bcas3Q8CCN5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Bcas3Q8CCN5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Bcas3Q8CCN5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bcas3Q8CCN5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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Bcas3Q8CCN5 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Bcas3Q8CCN5 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bcas3Q8CCN5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bcas3Q8CCN5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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Bcas3Q8CCN5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Bcas3Q8CCN5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Bcas3Q8CCN5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Bcas3Q8CCN5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Bcas3Q8CCN5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Bcas3Q8CCN5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Bcas3Q8CCN5 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Bcas3Q8CCN5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Bcas3Q8CCN5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Bcas3Q8CCN5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Bcas3Q8CCN5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Bcas3Q8CCN5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Bcas3Q8CCN5 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Bcas3Q8CCN5 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Bcas3Q8CCN5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Bcas3Q8CCN5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Bcas3Q8CCN5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Bcas3Q8CCN5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Bcas3Q8CCN5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Bcas3Q8CCN5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Bcas3Q8CCN5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Bcas3Q8CCN5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Bcas3Q8CCN5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Bcas3Q8CCN5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Bcas3Q8CCN5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Bcas3Q8CCN5 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Bcas3Q8CCN5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Bcas3Q8CCN5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Bcas3Q8CCN5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Bcas3Q8CCN5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Bcas3Q8CCN5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Bcas3Q8CCN5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Bcas3Q8CCN5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Bcas3Q8CCN5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Bcas3Q8CCN5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Bcas3Q8CCN5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms