Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCI5

Rybp, RING1 and YY1-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RybpQ8CCI5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RybpQ8CCI5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RybpQ8CCI5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RybpQ8CCI5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RybpQ8CCI5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RybpQ8CCI5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RybpQ8CCI5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RybpQ8CCI5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RybpQ8CCI5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RybpQ8CCI5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RybpQ8CCI5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RybpQ8CCI5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RybpQ8CCI5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RybpQ8CCI5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RybpQ8CCI5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RybpQ8CCI5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RybpQ8CCI5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RybpQ8CCI5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RybpQ8CCI5 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RybpQ8CCI5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RybpQ8CCI5 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RybpQ8CCI5 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RybpQ8CCI5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RybpQ8CCI5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RybpQ8CCI5 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RybpQ8CCI5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RybpQ8CCI5 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RybpQ8CCI5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RybpQ8CCI5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RybpQ8CCI5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RybpQ8CCI5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RybpQ8CCI5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RybpQ8CCI5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RybpQ8CCI5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RybpQ8CCI5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RybpQ8CCI5 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RybpQ8CCI5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RybpQ8CCI5 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RybpQ8CCI5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RybpQ8CCI5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RybpQ8CCI5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RybpQ8CCI5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RybpQ8CCI5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RybpQ8CCI5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RybpQ8CCI5 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RybpQ8CCI5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RybpQ8CCI5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RybpQ8CCI5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RybpQ8CCI5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RybpQ8CCI5 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RybpQ8CCI5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RybpQ8CCI5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RybpQ8CCI5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RybpQ8CCI5 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RybpQ8CCI5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RybpQ8CCI5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RybpQ8CCI5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RybpQ8CCI5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RybpQ8CCI5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RybpQ8CCI5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RybpQ8CCI5 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RybpQ8CCI5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RybpQ8CCI5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RybpQ8CCI5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RybpQ8CCI5 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RybpQ8CCI5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RybpQ8CCI5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RybpQ8CCI5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RybpQ8CCI5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RybpQ8CCI5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RybpQ8CCI5 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RybpQ8CCI5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RybpQ8CCI5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RybpQ8CCI5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RybpQ8CCI5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RybpQ8CCI5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RybpQ8CCI5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RybpQ8CCI5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RybpQ8CCI5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RybpQ8CCI5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RybpQ8CCI5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RybpQ8CCI5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RybpQ8CCI5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RybpQ8CCI5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RybpQ8CCI5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RybpQ8CCI5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RybpQ8CCI5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RybpQ8CCI5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RybpQ8CCI5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RybpQ8CCI5 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RybpQ8CCI5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RybpQ8CCI5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RybpQ8CCI5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RybpQ8CCI5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RybpQ8CCI5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RybpQ8CCI5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RybpQ8CCI5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RybpQ8CCI5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RybpQ8CCI5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RybpQ8CCI5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms