Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBC6

Lrrn3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, mousemouse

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Length 707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn3Q8CBC6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrrn3Q8CBC6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrrn3Q8CBC6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrrn3Q8CBC6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrrn3Q8CBC6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrrn3Q8CBC6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrrn3Q8CBC6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrrn3Q8CBC6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrrn3Q8CBC6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrrn3Q8CBC6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrrn3Q8CBC6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrrn3Q8CBC6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrrn3Q8CBC6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrrn3Q8CBC6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrrn3Q8CBC6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Lrrn3Q8CBC6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrrn3Q8CBC6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrrn3Q8CBC6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrrn3Q8CBC6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrrn3Q8CBC6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrrn3Q8CBC6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrrn3Q8CBC6 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrrn3Q8CBC6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrrn3Q8CBC6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrrn3Q8CBC6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrrn3Q8CBC6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrrn3Q8CBC6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrrn3Q8CBC6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrn3Q8CBC6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrn3Q8CBC6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrn3Q8CBC6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrn3Q8CBC6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrn3Q8CBC6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrn3Q8CBC6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrn3Q8CBC6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrn3Q8CBC6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrn3Q8CBC6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrn3Q8CBC6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrn3Q8CBC6 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrn3Q8CBC6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrn3Q8CBC6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrn3Q8CBC6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrn3Q8CBC6 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrn3Q8CBC6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrn3Q8CBC6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrn3Q8CBC6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrn3Q8CBC6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrn3Q8CBC6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrn3Q8CBC6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrn3Q8CBC6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrn3Q8CBC6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrn3Q8CBC6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrn3Q8CBC6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrn3Q8CBC6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrn3Q8CBC6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrn3Q8CBC6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrn3Q8CBC6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrn3Q8CBC6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrn3Q8CBC6 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrn3Q8CBC6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrn3Q8CBC6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrn3Q8CBC6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrn3Q8CBC6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrn3Q8CBC6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrn3Q8CBC6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrn3Q8CBC6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrn3Q8CBC6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrn3Q8CBC6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrn3Q8CBC6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrn3Q8CBC6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrn3Q8CBC6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrn3Q8CBC6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrn3Q8CBC6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrn3Q8CBC6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrn3Q8CBC6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrn3Q8CBC6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrn3Q8CBC6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrn3Q8CBC6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrn3Q8CBC6 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrn3Q8CBC6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrn3Q8CBC6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrn3Q8CBC6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrn3Q8CBC6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrn3Q8CBC6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrn3Q8CBC6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrn3Q8CBC6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrn3Q8CBC6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrn3Q8CBC6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrn3Q8CBC6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrn3Q8CBC6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrn3Q8CBC6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrn3Q8CBC6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lrrn3Q8CBC6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lrrn3Q8CBC6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrn3Q8CBC6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrn3Q8CBC6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrn3Q8CBC6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrn3Q8CBC6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrn3Q8CBC6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrn3Q8CBC6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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