Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp20Q8C6M1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp20Q8C6M1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp20Q8C6M1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp20Q8C6M1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp20Q8C6M1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp20Q8C6M1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp20Q8C6M1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp20Q8C6M1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp20Q8C6M1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp20Q8C6M1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp20Q8C6M1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Usp20Q8C6M1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Usp20Q8C6M1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Usp20Q8C6M1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Usp20Q8C6M1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp20Q8C6M1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp20Q8C6M1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp20Q8C6M1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp20Q8C6M1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp20Q8C6M1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp20Q8C6M1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp20Q8C6M1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp20Q8C6M1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp20Q8C6M1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp20Q8C6M1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp20Q8C6M1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp20Q8C6M1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp20Q8C6M1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp20Q8C6M1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp20Q8C6M1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp20Q8C6M1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp20Q8C6M1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp20Q8C6M1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp20Q8C6M1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp20Q8C6M1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp20Q8C6M1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp20Q8C6M1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp20Q8C6M1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp20Q8C6M1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp20Q8C6M1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp20Q8C6M1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp20Q8C6M1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp20Q8C6M1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp20Q8C6M1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp20Q8C6M1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp20Q8C6M1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp20Q8C6M1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp20Q8C6M1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp20Q8C6M1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp20Q8C6M1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp20Q8C6M1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp20Q8C6M1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp20Q8C6M1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp20Q8C6M1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp20Q8C6M1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp20Q8C6M1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp20Q8C6M1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp20Q8C6M1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp20Q8C6M1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp20Q8C6M1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp20Q8C6M1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp20Q8C6M1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp20Q8C6M1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp20Q8C6M1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp20Q8C6M1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp20Q8C6M1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp20Q8C6M1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp20Q8C6M1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp20Q8C6M1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp20Q8C6M1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp20Q8C6M1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Usp20Q8C6M1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp20Q8C6M1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp20Q8C6M1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp20Q8C6M1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp20Q8C6M1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp20Q8C6M1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp20Q8C6M1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp20Q8C6M1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp20Q8C6M1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp20Q8C6M1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp20Q8C6M1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp20Q8C6M1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp20Q8C6M1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp20Q8C6M1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp20Q8C6M1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp20Q8C6M1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp20Q8C6M1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp20Q8C6M1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp20Q8C6M1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp20Q8C6M1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp20Q8C6M1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp20Q8C6M1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp20Q8C6M1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp20Q8C6M1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp20Q8C6M1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp20Q8C6M1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp20Q8C6M1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp20Q8C6M1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
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