Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc113Q8C5T8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc113Q8C5T8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc113Q8C5T8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc113Q8C5T8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc113Q8C5T8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc113Q8C5T8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc113Q8C5T8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc113Q8C5T8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc113Q8C5T8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc113Q8C5T8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc113Q8C5T8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc113Q8C5T8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc113Q8C5T8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc113Q8C5T8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc113Q8C5T8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc113Q8C5T8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc113Q8C5T8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc113Q8C5T8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc113Q8C5T8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc113Q8C5T8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc113Q8C5T8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc113Q8C5T8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc113Q8C5T8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc113Q8C5T8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc113Q8C5T8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc113Q8C5T8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc113Q8C5T8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc113Q8C5T8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc113Q8C5T8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc113Q8C5T8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc113Q8C5T8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc113Q8C5T8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc113Q8C5T8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc113Q8C5T8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc113Q8C5T8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc113Q8C5T8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc113Q8C5T8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc113Q8C5T8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc113Q8C5T8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc113Q8C5T8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc113Q8C5T8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc113Q8C5T8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc113Q8C5T8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc113Q8C5T8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc113Q8C5T8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc113Q8C5T8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc113Q8C5T8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc113Q8C5T8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc113Q8C5T8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc113Q8C5T8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc113Q8C5T8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc113Q8C5T8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc113Q8C5T8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc113Q8C5T8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
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Ccdc113Q8C5T8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc113Q8C5T8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
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Ccdc113Q8C5T8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc113Q8C5T8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc113Q8C5T8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc113Q8C5T8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc113Q8C5T8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc113Q8C5T8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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Ccdc113Q8C5T8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc113Q8C5T8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc113Q8C5T8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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Ccdc113Q8C5T8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc113Q8C5T8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc113Q8C5T8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc113Q8C5T8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc113Q8C5T8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc113Q8C5T8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc113Q8C5T8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc113Q8C5T8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc113Q8C5T8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc113Q8C5T8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc113Q8C5T8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc113Q8C5T8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc113Q8C5T8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc113Q8C5T8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc113Q8C5T8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc113Q8C5T8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc113Q8C5T8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc113Q8C5T8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc113Q8C5T8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc113Q8C5T8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc113Q8C5T8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc113Q8C5T8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc113Q8C5T8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc113Q8C5T8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc113Q8C5T8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc113Q8C5T8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc113Q8C5T8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc113Q8C5T8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc113Q8C5T8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms