Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ssuh2Q8C3L1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ssuh2Q8C3L1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ssuh2Q8C3L1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ssuh2Q8C3L1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ssuh2Q8C3L1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ssuh2Q8C3L1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ssuh2Q8C3L1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ssuh2Q8C3L1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ssuh2Q8C3L1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ssuh2Q8C3L1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ssuh2Q8C3L1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ssuh2Q8C3L1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ssuh2Q8C3L1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ssuh2Q8C3L1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ssuh2Q8C3L1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ssuh2Q8C3L1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ssuh2Q8C3L1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ssuh2Q8C3L1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ssuh2Q8C3L1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ssuh2Q8C3L1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ssuh2Q8C3L1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ssuh2Q8C3L1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ssuh2Q8C3L1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ssuh2Q8C3L1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ssuh2Q8C3L1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ssuh2Q8C3L1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ssuh2Q8C3L1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ssuh2Q8C3L1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ssuh2Q8C3L1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ssuh2Q8C3L1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ssuh2Q8C3L1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ssuh2Q8C3L1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssuh2Q8C3L1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssuh2Q8C3L1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssuh2Q8C3L1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssuh2Q8C3L1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssuh2Q8C3L1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssuh2Q8C3L1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssuh2Q8C3L1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssuh2Q8C3L1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssuh2Q8C3L1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssuh2Q8C3L1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssuh2Q8C3L1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssuh2Q8C3L1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssuh2Q8C3L1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssuh2Q8C3L1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssuh2Q8C3L1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssuh2Q8C3L1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssuh2Q8C3L1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssuh2Q8C3L1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssuh2Q8C3L1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssuh2Q8C3L1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssuh2Q8C3L1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssuh2Q8C3L1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssuh2Q8C3L1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssuh2Q8C3L1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssuh2Q8C3L1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssuh2Q8C3L1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssuh2Q8C3L1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssuh2Q8C3L1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssuh2Q8C3L1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssuh2Q8C3L1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssuh2Q8C3L1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssuh2Q8C3L1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssuh2Q8C3L1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssuh2Q8C3L1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssuh2Q8C3L1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssuh2Q8C3L1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssuh2Q8C3L1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssuh2Q8C3L1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssuh2Q8C3L1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssuh2Q8C3L1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssuh2Q8C3L1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssuh2Q8C3L1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssuh2Q8C3L1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssuh2Q8C3L1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssuh2Q8C3L1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ssuh2Q8C3L1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ssuh2Q8C3L1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ssuh2Q8C3L1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ssuh2Q8C3L1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ssuh2Q8C3L1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ssuh2Q8C3L1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ssuh2Q8C3L1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ssuh2Q8C3L1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ssuh2Q8C3L1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ssuh2Q8C3L1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ssuh2Q8C3L1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ssuh2Q8C3L1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ssuh2Q8C3L1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ssuh2Q8C3L1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ssuh2Q8C3L1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ssuh2Q8C3L1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ssuh2Q8C3L1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ssuh2Q8C3L1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ssuh2Q8C3L1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ssuh2Q8C3L1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ssuh2Q8C3L1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ssuh2Q8C3L1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms