Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0E3

Trim47, Tripartite motif-containing protein 47, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim47Q8C0E3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim47Q8C0E3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim47Q8C0E3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim47Q8C0E3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim47Q8C0E3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim47Q8C0E3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim47Q8C0E3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim47Q8C0E3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim47Q8C0E3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim47Q8C0E3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim47Q8C0E3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim47Q8C0E3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim47Q8C0E3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim47Q8C0E3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim47Q8C0E3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim47Q8C0E3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim47Q8C0E3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim47Q8C0E3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim47Q8C0E3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim47Q8C0E3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim47Q8C0E3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim47Q8C0E3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim47Q8C0E3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim47Q8C0E3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim47Q8C0E3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim47Q8C0E3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim47Q8C0E3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim47Q8C0E3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim47Q8C0E3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim47Q8C0E3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim47Q8C0E3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim47Q8C0E3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim47Q8C0E3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim47Q8C0E3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim47Q8C0E3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim47Q8C0E3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim47Q8C0E3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim47Q8C0E3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim47Q8C0E3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim47Q8C0E3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim47Q8C0E3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trim47Q8C0E3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trim47Q8C0E3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trim47Q8C0E3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim47Q8C0E3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim47Q8C0E3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim47Q8C0E3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim47Q8C0E3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim47Q8C0E3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim47Q8C0E3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim47Q8C0E3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim47Q8C0E3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim47Q8C0E3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim47Q8C0E3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim47Q8C0E3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim47Q8C0E3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim47Q8C0E3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim47Q8C0E3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim47Q8C0E3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim47Q8C0E3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim47Q8C0E3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim47Q8C0E3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim47Q8C0E3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim47Q8C0E3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim47Q8C0E3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim47Q8C0E3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim47Q8C0E3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim47Q8C0E3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim47Q8C0E3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim47Q8C0E3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim47Q8C0E3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim47Q8C0E3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim47Q8C0E3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim47Q8C0E3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim47Q8C0E3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim47Q8C0E3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim47Q8C0E3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim47Q8C0E3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim47Q8C0E3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim47Q8C0E3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim47Q8C0E3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim47Q8C0E3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim47Q8C0E3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim47Q8C0E3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim47Q8C0E3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim47Q8C0E3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim47Q8C0E3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim47Q8C0E3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim47Q8C0E3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim47Q8C0E3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim47Q8C0E3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim47Q8C0E3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim47Q8C0E3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim47Q8C0E3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim47Q8C0E3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim47Q8C0E3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim47Q8C0E3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim47Q8C0E3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim47Q8C0E3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim47Q8C0E3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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