Protein–RNA interactions for Protein: Q8C050

Rps6ka5, Ribosomal protein S6 kinase alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka5Q8C050 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rps6ka5Q8C050 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rps6ka5Q8C050 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rps6ka5Q8C050 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rps6ka5Q8C050 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rps6ka5Q8C050 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rps6ka5Q8C050 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rps6ka5Q8C050 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rps6ka5Q8C050 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rps6ka5Q8C050 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rps6ka5Q8C050 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rps6ka5Q8C050 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rps6ka5Q8C050 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rps6ka5Q8C050 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rps6ka5Q8C050 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rps6ka5Q8C050 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rps6ka5Q8C050 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Rps6ka5Q8C050 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Rps6ka5Q8C050 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rps6ka5Q8C050 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rps6ka5Q8C050 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rps6ka5Q8C050 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rps6ka5Q8C050 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Rps6ka5Q8C050 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rps6ka5Q8C050 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rps6ka5Q8C050 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rps6ka5Q8C050 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rps6ka5Q8C050 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rps6ka5Q8C050 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rps6ka5Q8C050 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rps6ka5Q8C050 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rps6ka5Q8C050 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rps6ka5Q8C050 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rps6ka5Q8C050 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rps6ka5Q8C050 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Rps6ka5Q8C050 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rps6ka5Q8C050 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rps6ka5Q8C050 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rps6ka5Q8C050 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rps6ka5Q8C050 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rps6ka5Q8C050 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rps6ka5Q8C050 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rps6ka5Q8C050 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rps6ka5Q8C050 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rps6ka5Q8C050 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rps6ka5Q8C050 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Rps6ka5Q8C050 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rps6ka5Q8C050 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rps6ka5Q8C050 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rps6ka5Q8C050 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rps6ka5Q8C050 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rps6ka5Q8C050 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Rps6ka5Q8C050 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rps6ka5Q8C050 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rps6ka5Q8C050 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rps6ka5Q8C050 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rps6ka5Q8C050 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rps6ka5Q8C050 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rps6ka5Q8C050 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rps6ka5Q8C050 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rps6ka5Q8C050 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rps6ka5Q8C050 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rps6ka5Q8C050 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rps6ka5Q8C050 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rps6ka5Q8C050 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rps6ka5Q8C050 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Rps6ka5Q8C050 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rps6ka5Q8C050 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rps6ka5Q8C050 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rps6ka5Q8C050 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rps6ka5Q8C050 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rps6ka5Q8C050 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rps6ka5Q8C050 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rps6ka5Q8C050 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rps6ka5Q8C050 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rps6ka5Q8C050 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rps6ka5Q8C050 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rps6ka5Q8C050 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rps6ka5Q8C050 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rps6ka5Q8C050 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rps6ka5Q8C050 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rps6ka5Q8C050 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rps6ka5Q8C050 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rps6ka5Q8C050 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rps6ka5Q8C050 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rps6ka5Q8C050 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rps6ka5Q8C050 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rps6ka5Q8C050 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rps6ka5Q8C050 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rps6ka5Q8C050 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rps6ka5Q8C050 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rps6ka5Q8C050 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rps6ka5Q8C050 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rps6ka5Q8C050 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rps6ka5Q8C050 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rps6ka5Q8C050 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rps6ka5Q8C050 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rps6ka5Q8C050 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Rps6ka5Q8C050 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rps6ka5Q8C050 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms