Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA6

Cldn17, Claudin-17, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn17Q8BXA6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cldn17Q8BXA6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cldn17Q8BXA6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cldn17Q8BXA6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cldn17Q8BXA6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cldn17Q8BXA6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cldn17Q8BXA6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cldn17Q8BXA6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cldn17Q8BXA6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn17Q8BXA6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn17Q8BXA6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn17Q8BXA6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn17Q8BXA6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn17Q8BXA6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn17Q8BXA6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn17Q8BXA6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn17Q8BXA6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn17Q8BXA6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn17Q8BXA6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn17Q8BXA6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn17Q8BXA6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn17Q8BXA6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn17Q8BXA6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn17Q8BXA6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn17Q8BXA6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn17Q8BXA6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn17Q8BXA6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn17Q8BXA6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn17Q8BXA6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn17Q8BXA6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn17Q8BXA6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn17Q8BXA6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn17Q8BXA6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn17Q8BXA6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn17Q8BXA6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn17Q8BXA6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn17Q8BXA6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn17Q8BXA6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn17Q8BXA6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn17Q8BXA6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn17Q8BXA6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn17Q8BXA6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn17Q8BXA6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn17Q8BXA6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn17Q8BXA6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn17Q8BXA6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn17Q8BXA6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn17Q8BXA6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn17Q8BXA6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn17Q8BXA6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn17Q8BXA6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn17Q8BXA6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn17Q8BXA6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn17Q8BXA6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn17Q8BXA6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn17Q8BXA6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn17Q8BXA6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn17Q8BXA6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn17Q8BXA6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn17Q8BXA6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn17Q8BXA6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn17Q8BXA6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn17Q8BXA6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn17Q8BXA6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn17Q8BXA6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn17Q8BXA6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn17Q8BXA6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn17Q8BXA6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn17Q8BXA6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn17Q8BXA6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn17Q8BXA6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn17Q8BXA6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn17Q8BXA6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn17Q8BXA6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn17Q8BXA6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn17Q8BXA6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn17Q8BXA6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn17Q8BXA6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn17Q8BXA6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn17Q8BXA6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn17Q8BXA6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn17Q8BXA6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn17Q8BXA6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn17Q8BXA6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn17Q8BXA6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn17Q8BXA6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cldn17Q8BXA6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cldn17Q8BXA6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn17Q8BXA6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn17Q8BXA6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn17Q8BXA6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn17Q8BXA6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn17Q8BXA6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn17Q8BXA6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn17Q8BXA6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn17Q8BXA6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn17Q8BXA6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn17Q8BXA6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn17Q8BXA6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn17Q8BXA6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms