Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX32

Slx1b, Structure-specific endonuclease subunit SLX1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx1bQ8BX32 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Slx1bQ8BX32 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Slx1bQ8BX32 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Slx1bQ8BX32 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Slx1bQ8BX32 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Slx1bQ8BX32 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Slx1bQ8BX32 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Slx1bQ8BX32 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Slx1bQ8BX32 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Slx1bQ8BX32 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Slx1bQ8BX32 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Slx1bQ8BX32 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Slx1bQ8BX32 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Slx1bQ8BX32 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Slx1bQ8BX32 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Slx1bQ8BX32 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Slx1bQ8BX32 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Slx1bQ8BX32 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Slx1bQ8BX32 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Slx1bQ8BX32 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Slx1bQ8BX32 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Slx1bQ8BX32 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Slx1bQ8BX32 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Slx1bQ8BX32 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Slx1bQ8BX32 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Slx1bQ8BX32 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Slx1bQ8BX32 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Slx1bQ8BX32 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Slx1bQ8BX32 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Slx1bQ8BX32 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Slx1bQ8BX32 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Slx1bQ8BX32 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Slx1bQ8BX32 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Slx1bQ8BX32 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Slx1bQ8BX32 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Slx1bQ8BX32 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Slx1bQ8BX32 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Slx1bQ8BX32 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Slx1bQ8BX32 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Slx1bQ8BX32 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Slx1bQ8BX32 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Slx1bQ8BX32 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Slx1bQ8BX32 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Slx1bQ8BX32 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Slx1bQ8BX32 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Slx1bQ8BX32 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Slx1bQ8BX32 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Slx1bQ8BX32 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Slx1bQ8BX32 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Slx1bQ8BX32 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Slx1bQ8BX32 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Slx1bQ8BX32 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Slx1bQ8BX32 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Slx1bQ8BX32 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Slx1bQ8BX32 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Slx1bQ8BX32 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Slx1bQ8BX32 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Slx1bQ8BX32 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Slx1bQ8BX32 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Slx1bQ8BX32 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Slx1bQ8BX32 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Slx1bQ8BX32 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Slx1bQ8BX32 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Slx1bQ8BX32 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Slx1bQ8BX32 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Slx1bQ8BX32 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Slx1bQ8BX32 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Slx1bQ8BX32 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Slx1bQ8BX32 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Slx1bQ8BX32 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Slx1bQ8BX32 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Slx1bQ8BX32 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Slx1bQ8BX32 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Slx1bQ8BX32 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Slx1bQ8BX32 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Slx1bQ8BX32 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Slx1bQ8BX32 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Slx1bQ8BX32 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Slx1bQ8BX32 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Slx1bQ8BX32 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Slx1bQ8BX32 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Slx1bQ8BX32 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Slx1bQ8BX32 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Slx1bQ8BX32 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Slx1bQ8BX32 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Slx1bQ8BX32 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Slx1bQ8BX32 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Slx1bQ8BX32 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Slx1bQ8BX32 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Slx1bQ8BX32 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Slx1bQ8BX32 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Slx1bQ8BX32 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Slx1bQ8BX32 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Slx1bQ8BX32 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Slx1bQ8BX32 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Slx1bQ8BX32 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Slx1bQ8BX32 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Slx1bQ8BX32 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Slx1bQ8BX32 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Slx1bQ8BX32 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms