Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TtpaQ8BWP5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TtpaQ8BWP5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TtpaQ8BWP5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TtpaQ8BWP5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TtpaQ8BWP5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TtpaQ8BWP5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TtpaQ8BWP5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TtpaQ8BWP5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TtpaQ8BWP5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TtpaQ8BWP5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TtpaQ8BWP5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TtpaQ8BWP5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TtpaQ8BWP5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TtpaQ8BWP5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TtpaQ8BWP5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TtpaQ8BWP5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TtpaQ8BWP5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TtpaQ8BWP5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TtpaQ8BWP5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TtpaQ8BWP5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TtpaQ8BWP5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TtpaQ8BWP5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TtpaQ8BWP5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TtpaQ8BWP5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TtpaQ8BWP5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TtpaQ8BWP5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TtpaQ8BWP5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TtpaQ8BWP5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TtpaQ8BWP5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TtpaQ8BWP5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TtpaQ8BWP5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TtpaQ8BWP5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TtpaQ8BWP5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TtpaQ8BWP5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TtpaQ8BWP5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TtpaQ8BWP5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TtpaQ8BWP5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TtpaQ8BWP5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TtpaQ8BWP5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TtpaQ8BWP5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TtpaQ8BWP5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TtpaQ8BWP5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TtpaQ8BWP5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TtpaQ8BWP5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TtpaQ8BWP5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TtpaQ8BWP5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TtpaQ8BWP5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TtpaQ8BWP5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TtpaQ8BWP5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TtpaQ8BWP5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TtpaQ8BWP5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TtpaQ8BWP5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TtpaQ8BWP5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TtpaQ8BWP5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TtpaQ8BWP5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TtpaQ8BWP5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TtpaQ8BWP5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TtpaQ8BWP5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TtpaQ8BWP5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TtpaQ8BWP5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TtpaQ8BWP5 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TtpaQ8BWP5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TtpaQ8BWP5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TtpaQ8BWP5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TtpaQ8BWP5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TtpaQ8BWP5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TtpaQ8BWP5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TtpaQ8BWP5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TtpaQ8BWP5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TtpaQ8BWP5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TtpaQ8BWP5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TtpaQ8BWP5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TtpaQ8BWP5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TtpaQ8BWP5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TtpaQ8BWP5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TtpaQ8BWP5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TtpaQ8BWP5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TtpaQ8BWP5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TtpaQ8BWP5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TtpaQ8BWP5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TtpaQ8BWP5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TtpaQ8BWP5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TtpaQ8BWP5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TtpaQ8BWP5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TtpaQ8BWP5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TtpaQ8BWP5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TtpaQ8BWP5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TtpaQ8BWP5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TtpaQ8BWP5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TtpaQ8BWP5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TtpaQ8BWP5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TtpaQ8BWP5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TtpaQ8BWP5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TtpaQ8BWP5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TtpaQ8BWP5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TtpaQ8BWP5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TtpaQ8BWP5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TtpaQ8BWP5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TtpaQ8BWP5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms